Laboratórna diagnostika enterosanových profilov - diagnostika stolice a vaginálna diagnostika

Profily klíčkov

„Kto je kto“ črevných mikróbov

Tu nájdete stručné popisy črevných zárodkov, ktoré je možné bežne diagnostikovať zo stolice. Rozlišujú sa dve skupiny:

Povinné črevné zárodky = Reprezentant normálnej flóry čreva
Pasívne choroboplodné zárodky = "Cudzie" choroboplodné zárodky, ktoré sa do čreva dostávajú z vonkajšieho sveta. Je zabránené usadzovaniu v zdravom čreve. Ich zvýšený výskyt sa má interpretovať ako indikácia narušenej črevnej bariéry.

Escherichia (E.) coli

E. coli je určite najznámejšia a najlepšie študovaná baktéria na svete. V čreve však tvorí menej ako 0,1% miestnej flóry.

E. coli je jednou z povinných rastlín hrubého čreva u ľudí a mnohých zvierat.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné črevné klíčky.
Spotreba kyslíka v čreve, a tým sa pripravuje pôda pre anaeróbne baktérie.
Ochrana proti cudzím mikroorganizmom produkciou mastných kyselín s krátkym reťazcom a kolicínov (= mikrobicídne proteíny).
Výcvik imunitného systému spojeného s črevom.

Metabolické spektrum:

Sacharidová fermentácia s produkciou mastných kyselín s krátkym reťazcom a plynných metabolitov (vodík a oxid uhličitý).
Spotreba kyslíka v čreve, a tým sa pripravuje pôda pre anaeróbne baktérie.

Varianty Escherichia coli

Varianty E. coli sa líšia svojim metabolickým správaním od predstaviteľov domácej flóry. Pri rutinnej bakteriologickej diagnostike možno ľahko demonštrovať dva metabolické varianty:

A. Varianty E. coli negatívne na laktózu

Tieto kmene nemôžu využiť cukor laktózu. Detekcia sa uskutočňuje na kultivačnom médiu obsahujúcom laktózu.
Dôležité: Dôkazy sa netýkajú laktózovej intolerancie hostiteľského organizmu!

B. Hemolytické varianty E. coli

Tieto kmene môžu lyžovať erytrocyty. Dôkazy sú založené na hemolýze na živných médiách obsahujúcich krv.

Varianty E. coli sa vyskytujú ako prechodné choroboplodné zárodky po orálnom užití potravy dočasne a v nízkom počte zárodkov dokonca aj v zdravých črevách.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Pasívne choroboplodné zárodky.
Nie je sám o sebe patogénny, ale nemá preukázané pozitívne účinky.
Počet baktérií vyšší ako 105 CFU/g stolice naznačuje narušenie kolonizačnej rezistencie. Často spojená s nadmernou dodávkou bielkovín v čreve (podvýživa, poruchy trávenia, zápal slizníc).
Nemá sa porovnávať s enteropatogénnymi E. coli (napr. EHEC). Ich detekcia si vyžaduje špeciálnu diagnostiku.

Metabolické spektrum:

Hlavne použitie bielkovín. Produkcia amoniaku (alkalizácia stolice) a rôznych biogénnych amínov (histamín, putrescín, tyramín atď.).

Ostatné Enterobacteriaceae

Okrem E. coli možno v stolici zistiť aj ďalších zástupcov čeľade Enterobacteriaceae, ktorá v súčasnosti zahŕňa asi 80 druhov. Najmä Klebsiella spp., Proteus spp., Enterobacter spp. a Citrobacter spp. na.

Klebsiella spp., Proteus spp., Enterobacter spp. a Citrobacter spp. sa nachádzajú rozšírené v životnom prostredí, najmä v pôde, vode a na rastlinných materiáloch.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Pasívne choroboplodné zárodky.
Žiadne preukázané pozitívne účinky na črevnú ekológiu.
Počty baktérií v stolici nad 105 CFU/g stolice naznačujú narušenie kolonizačnej rezistencie alebo podvýživy (vysoký obsah bielkovín) alebo tráviacej nedostatočnosti (zhoršené trávenie bielkovín).
Detekcia Klebsiella, Enterobacter a Citrobacter v stolici ľudí konzumujúcich surovú stravu, pravdepodobne „normálny nález“. Tieto zárodky patria k normálnej flóre mnohých rastlín.

Metabolické spektrum:

Hlavne využitie bielkovín s produkciou amoniaku (alkalizácia stolice) a biogénnych amínov (napr. Kadaverínu a putrescínu).

Enterococcus spp.

Enterokoky sú súčasťou povinnej flóry tenkého a hrubého čreva.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné črevné zárodky.
Ochrana proti prechodným choroboplodným zárodkom prostredníctvom tvorby mikrobicídnych látok, ako sú mastné kyseliny s krátkym reťazcom, peroxid vodíka a rôzne bakteriocíny (enterocíny).

Metabolické spektrum:

Hlavne premena sacharidov na produkciu mastných kyselín s krátkym reťazcom (napr. Kyselina octová, kyselina propiónová a kyselina mliečna). Okysľujú črevné prostredie, stimulujú prietok krvi do sliznice čreva a intestinálnu motilitu a pokrývajú 40 - 50% energetických požiadaviek buniek epitelu hrubého čreva. Okrem toho majú tiež priamy antagonistický účinok na rôzne prechodné zárodky.

Ostatné aeróbne baktérie

Menej často sa v stolici vyskytujú aj zástupcovia rodov Pseudomonas, Bacillus, Staphylococcus a Streptococcus.

rozšírená, kolonizácia rôznych environmentálnych materiálov (Pseudomonas spp., Bacillus spp.)

Časť miestnej flóry kože a horných dýchacích ciest ľudí a zvierat (Staphylococcus spp., Streptococcus spp.).

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Pasívne choroboplodné zárodky.
Nie sú známe žiadne priaznivé účinky na črevný ekosystém.
Počty baktérií nad 104 CFU/g stolice sa majú interpretovať ako indikácia narušenia kolonizačnej rezistencie.
Niektoré druhy z rodov Pseudomonas, Staphylococcus a Bacillus môžu tiež spôsobovať hnačky.
ß-hemolyzujúce streptokoky sa izolujú zo stolice, najmä v prípade proktologických problémov (hemoroidné komplikácie, análne trhliny, fistuly) alebo zo zdrojov infekcie v oblasti ORL (napr. tonzilitída, sinusitída).

Metabolické spektrum:

U Pseudomonas spp. a Bacillus spp. Dôraz sa kladie na využitie bielkovín.
Stafylokoky a streptokoky zvyčajne nie sú zvlášť zreteľné, pokiaľ ide o ich metabolickú aktivitu.

Bacteroides spp.

Pre jednoduchosť sú zástupcovia troch obligátne anaeróbnych rodov, tj. Bacteroides, Prevotella a Porphyromonas, ktoré rastú iba s vylúčením kyslíka, v mikroekologickej rutine často zahrnutí pod starý všeobecný názov „Bacteroides“.

Bacteroides spp., Prevotella spp. a Porphyromonas spp. sú viazané na teplokrvné organizmy a sú súčasťou flóry hrubého čreva a urogenitálneho traktu.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné črevné zárodky, hlavná zložka povinnej flóry hrubého čreva.

Metabolické spektrum:

Relatívne malá metabolická aktivita.
Okrem využitia sacharidov predovšetkým premena bielkovín.
Niektorí zástupcovia môžu syntetizovať takzvané fekapentaény z žlčových kyselín. Niektoré z nich sa preukázali ako mutagénne (mutagénne).

Clostridium spp.

Clostridia sú mikróby, ktoré rastú anaeróbne, to znamená, že rastú iba za neprítomnosti kyslíka. Vďaka vzniku trvalých foriem (spór) sú mimoriadne odolné voči nepriaznivým vplyvom prostredia. Medzi klostrídiami je niekoľko dôležitých patogénov:

Clostridioides difficile ako pôvodca kolitídy spojenej s antibiotikami (AAC).

Clostridium perfringens, ako pôvodca toxických infekcií (okrem iného príčinou otravy jedlom). Ich zaznamenávanie si však vyžaduje špeciálne overovacie postupy.

Ostatní patogénni zástupcovia tohto rodu, ako sú patogény intoxikácie (Cl. Botulinum), toxických infekcií (Cl. Tetani) a infekčných chorôb (Cl. Chauvoei, Cl. Septicum, Cl. Novyi), nemajú v črevnom kanáli človeka väčšinou žiadny klinický význam.

Prirodzená poloha klostrídií je v hrubých črevách ľudí a zvierat, ako aj v životnom prostredí (pôda).

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné zárodky hrubého čreva, ale bez preukázanej pozitívnej aktivity v črevnej ekológii.

Metabolické spektrum:

Bielkoviny a tuky sú hlavnými substrátmi klostrídií. Okrem amoniaku, sírovodíka a biogénnych amínov sa tvoria aj steroidné zlúčeniny, o ktorých sa preukázalo, že pôsobia ako kokarcinogény pri vývoji karcinómov hrubého čreva a prsníka.
Niektoré druhy Clostridia spp. sú tiež schopné transformovať steroidné jadro žlčových kyselín (NDH-Clostridia = Nuclear Dehyrogenating-Clostridia). Výsledné metabolity môžu byť tiež zapojené do karcinogenézy hrubého čreva.

Bifidobacterium spp.

Bifidobaktérie sú anaeróby, to znamená, že rastú iba pri nedostatku kyslíka.

Bifidobaktérie sú súčasťou povinnej flóry tenkého a hrubého čreva, ústnej dutiny a pošvy.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné črevné zárodky.
Hlavná zložka črevnej flóry dojčiat.
Obrana proti cudzím zárodkom, najmä prostredníctvom výroby mastných kyselín s krátkym reťazcom.

Metabolické spektrum:

Výhradne využitie sacharidov, najmä vlákniny v čreve. Výroba mastných kyselín s krátkym reťazcom, najmä kyseliny octovej a v menšej miere kyseliny mliečnej, bez tvorby plynov.

Lactobacillus spp.

Laktobacily rastú za zníženého napätia kyslíka, takže sa radia medzi mikroaerofilné zárodky.

Laktobacily sú súčasťou povinnej flóry tenkého a hrubého čreva, ústnej dutiny a pošvy.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Význam v čreve:

Povinné črevné zárodky.
Ochrana proti cudzím mikroorganizmom, najmä tvorbou mastných kyselín s krátkym reťazcom (najmä kyseliny mliečnej), peroxidu vodíka a rôznych bakteriocínov.

Metabolické spektrum:

Laktobacily sú čisté sacharolyty, ktoré bez tvorby plynov produkujú mastné kyseliny s krátkym reťazcom, najmä kyselinu mliečnu, a tým okrem iného spôsobujú okyslenie črevného prostredia.

Kvasinky

V súčasnosti je známych asi 500 druhov kvasiniek. Najväčší klinický význam majú zástupcovia rodu Candida, ktorý zahŕňa takmer 200 druhov. Dominantným druhom v klinických materiáloch je Candida albicans. Ostatné Candida spp., Saccharomyces spp., Trichosporon spp., Torulopsis spp., Rhodotorula spp., Cryptococcus spp. a Sporobolomyces spp. dokázané.

Dôležité: Dôkaz rastu plesní v stolici, najmä rodu Candida, je možné adekvátne vyhodnotiť iba v súvislosti so stavom hostiteľa a povinnou črevnou flórou. Izolované pozorovania zárodkov nezohľadňujú ich oportunistickú povahu. Plesňová kolonizácia čreva je preto vždy sekundárnym javom, a preto sa má spočiatku hodnotiť symptomaticky ako indikácia poruchy rezistencie na kolonizáciu čreva.

V prostredí sú rozšírené kvasinky.

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Dôležité: Počet zárodkov nameraných v stolici nie vždy odráža kvantitatívne proporcie akejkoľvek plesňovej kolonizácie, ktorá sa mohla vyskytnúť v čreve. Patogenetické hodnotenie hubových nálezov preto nesmie byť otrocky založené na počte zárodkov, ale musí vychádzať z klinických príznakov a stavu črevnej bariéry.

Význam v čreve:

Pasívne choroboplodné zárodky.
Dôkaz o priechodnosti je možný aj u zdravých ľudí kvôli rozšírenému použitiu droždia.
Usadenie sa v čreve iba vtedy, ak je narušená črevná bariéra.

Metabolické spektrum:

Vysoká metabolická aktivita.
Hlavne obrat sacharidov s produkciou oxidu uhličitého a etanolu.
Výroba fuselových olejov (amyl a izoamylalkohol) v dôsledku metabolizmu dusíka

Plesne

V stolici sú zistené druhy rodov Geotrichum, zriedkavejšie Mucor, Absidia, Rhizopus, Aspergillus a Penicillium.

V prostredí sú rozšírené plesne, najmä na rastlinných materiáloch. Geotrichum spp. sú tiež súčasťou normálnej mikroflóry mnohých mliečnych výrobkov (napr. mnohých tvrdých a mäkkých syrov).

Štandardný rozsah/rozsah tolerancie:

Pri prevažne lakto-zeleninovej strave sa v jednotlivých prípadoch počíta s vyšším počtom klíčkov v dôsledku zvýšeného príjmu plesní v potrave.

Význam v črevnej mikroekológii:

Pasívne choroboplodné zárodky. Zvýšené dôkazy väčšinou kvôli strave.
Črevná mykóza spôsobená plesňami, zvyčajne iba u ťažko imunokompromitovaných pacientov (AIDS, po chemoterapii, závažná cukrovka).
Zvýšená detekcia Geotrichum spp. časté pri psoriáze a zápalových ochoreniach čriev. Doteraz však nebola preukázaná žiadna etiologická súvislosť.

Metabolické spektrum:

Plesne v čreve - a to aj z dôvodu ich prevažne iba dočasného výskytu - nemajú žiadny význam z hľadiska ich metabolického správania.