Mircea-leabu-biomembranelepdf Stránky 51 - 100 - Flip PDF Stiahnite si FlipHTML5
Popis: Mircea leabu-biomembranelepdf
Kľúčové slová: 147
Prečítajte si textovú verziu
Mircea Leabu a Marina T. Nechifor - Biomembrány, jednota v rozmanitosti12. Bi S, Baum LG. (2009) Kyseliny sialové vo vývoji a funkcii T buniek. Biochim Biophys Acta. 1790: 1599-1610,13. Dafik L, z Alarcao M, Kumar K. (2010) Modulácia bunkovej adhézie pomocou glykoinžinierstva. J Med Chem. 53: 4277-4284,14. Drake-Holland AJ, Noble MI. (2009) Dôležitý nový cieľ liečiva v kardiovaskulárnej medicíne - vaskulárny glykokalyx. Ciele na lieky proti hematoencefalickej chorobe Cardiovasc. 9: 118-123,15. Du J, Yarema KJ. (2010) Sacharidom pripravené bunky pre regeneratívnu medicínu. Adv Drug Deliv Rev. 62: 671–682,16. Schwardt O, Kelm S, Ernst B. (2013) SIGLEC-4 (MAG) Antagonisti: Od prírodného sacharidového epitopu po glykomimetiká. Top Curr Chem. 26. novembra [Epub before print] DOI: 10.1007/128_2013_49817. Suzuki O, Abe M. (2013) Posledný pokrok a nové perspektívy v glykobiológii lymfómov. Fukushima J Med Sci. 59 (1): 1-14,18. Ryan JM, Rice GE, Mitchell MD. (2013) Úloha gangliozidov vo vývoji mozgu a potenciálne výhody perinatálnej suplementácie. Nutr Res. 33 (11): 877-887. DOI: 10.1016/j.nutres.2013.07.021.19. Pshezhetsky AV, Ashmarina LI. (2013) Desialylácia povrchových receptorov ako nový rozmer bunkovej signalizácie. Biochémia (Moskva). 78 (7): 736-745. DOI: 10.1134/S0006297913070067. 62
45 kDa, ktorý má 12 prechodov v -skrutkovici rovinou membrány, na úrovni ktorej nájdeme spolu s ďalšími hydrofóbnymi aminokyselinami Ser, Thr, Asn a Gln, polárne aminokyseliny zodpovedné počas transportného procesu za interakcia s molekulou glukózy prechádza cez membránu. Oba koncové konce polypeptidového reťazca sú exponované v cytosole. V bunke v membráne erytrocytov je viac ako 200 000 transportných molekúl GLUT1. GLUT1 je súčasťou rodiny 14-členných transportérov glukózy (GLUT1-14), všetky s 12 pasážami helix cez rovinu membrány a s N- a C-terminálnymi koncami v endodoméne. Transportéry GLUT sa nachádzajú aj v membránach iných typov živočíšnych buniek, nielen v erytrocytoch alebo v hematopoetickej erytroidnej línii [2-5]. V bazálnych podmienkach prechádzajú svalové bunky a adipocyty GLUT4 nepretržitým procesom, ale s nízkou dynamikou recyklácie medzi membránou a niekoľkými intracelulárnymi kompartmentmi, iba 5% z celkového počtu 74
Mircea Leabu a Marina T. Nechifor - Biomembranes, jednotka rozmanitosti označená NCX (z vešiaka Na trium-Calcium e Xc), boli identifikovaní traja členovia cicavcov: NCX1, NCX2 a NCX3. NCX1 sa nachádza takmer vo všetkých tkanivách, ale hojnejšie sa exprimuje v srdci, mozgu a obličkách [14]. NCX1 má 938 aminokyselín (110 kDa, odvoditeľná hmotnosť od aminokyselinovej sekvencie) a má 9 transmembránových domén v -helixe [15]. Amino koniec polypeptidového reťazca je na povrchu membrány, takže NCX1 je transmembránový proteín typu I a cytosolická slučka je štruktúrovaná medzi transmembránovými segmentmi 5 a 6 (t.j. na vnútorná strana membrány) z 550 aminokyselín (viac ako polovica dĺžky polypeptidového reťazca) nevyhnutných na reguláciu aktivity kanálu. Aktivita výmenníka Na +/Ca2 + závisí od extracelulárnej a cytosolickej dekoncentrácie vymenených katiónov, ale tiež od dekoncentrácie H +, ATP a bis-fosforylovaných fosfoinozitidov [13]. V závislosti na sklade membrány a koncentráciách na jednej alebo druhej strane membrány pre transportované katióny môže byť výmena obrátená. Je potrebné poznamenať, že v bunke srdcového svalu, kde je významne potrebný príspevok cytosolického vápnika potrebný na kontrakciu (
70%) sa uvoľňuje zo sarkoplazmatického retikula a len v malom rozsahu (
Mircea Leabu a Marina T. Nechifor - Biomembrány, jednotka v rozmanitosti Aquaporíny sú proteíny identifikované vo všetkých organizmoch (z baktérií, cicavcov a rastlín) a sú všadeprítomné v mnohobunkových organizmoch, pričom sú v rôznej miere exprimované vo všetkých bunkových typoch [ 23, 24]. U ľudí bolo identifikovaných najmenej 13 členov rodiny proteínov aquaporínu [24], skrátene AQPx (s x začínajúcim na 0, AQP0 je aquaporín v šošovke, pôvodne nazývaný hlavný integrálny proteín). MIP, od Ma jor I ntegral Pr otein, odtiaľ pochádza tendencia pomenovávať nadrodinu bielkovín, ku ktorej patria aj aquaporíny). Molekulárna identita prvého aquaporínu (AQP1) bola predmetom článku publikovaného tímom Petera Agreeho v roku 1992. Dohoda a spolupracovníci, ktorí mikroinjikovali oocyty Xenopus laevis s proteínovou mRNA CHIP28, hojne exprimovanou v membráne erytrocytov, zistili zvýšenie významná osmotická permeabilita vody [25]. Aquaporíny (obr. 3.6) sú proteínové transmembrány s molekulovou hmotnosťou
110 kDa (môže obsahovať medzi 1014 a 1028 aminokyselinami), má 10 prechodov v -skrutkovici cez membránovú lipidovú dvojvrstvu (skrátene TM1 - TM10; na obr. 3.7. Sú očíslované v poradí, s číslicami 1-10), a amino- aj karboxy-koncové konce polypeptidového reťazca sú v endodoméne [29]. Existujú štyri podjednotkové izoformy: 1, ktorá má polypeptidový reťazec pozostávajúci z 1024 aminokyselín, 2, s 12121 aminokyselinami, 3, iba s 1014 aminokyselinami, a 4, s najdlhším polypeptidovým reťazcom, obsahujúce 1028 aminokyselín [29, 30]. Extracelulárna doména je malá a pozostáva z dvoch malých slučiek, prvá medzi transmembránovými doménami TM1 a TM2 (asi 12 aminokyselín zodpovedných za interakciu s vajíčkom, ktorá inhibuje činnosť pumpy) a druhá medzi TM7 a TM8 (okolo 39 aminokyselín). Ostatné extracelulárne slučky sú nevýznamné (každá s 3-4 aminokyselinami), pokiaľ ide o účasť na organizácii extracelulárnej domény proteínu. Cytosolická doména je bohatá a skladá sa z: (i) N-koncovej časti podjednotky (prvých 90 - 97 aminokyselín polypeptidového reťazca), (ii) slučky strednej dĺžky medzi transmembránovými doménami TM2. A TM3 (skladajúci sa z
143 aminokyselín), (iii) veľká slučka tvorená polypeptidovým reťazcom medzi TM4 a TM5 (má asi 439 aminokyselín - obsahuje kyselinu asparágovú, ktorá fosforyluje v cykle pumpy, a (iv) dve významne menšie slučky medzi TM6, TM7 (28 aminokyselín) a medzi TM8, TM9 (27 aminokyselín) a (v) malý C-koniec z posledných 21 aminokyselín polypeptidového reťazca) [31]. V tomto komplexe endodomény sú prítomné väzbové miesta pre sodík (súčasne sú spojené 3 ióny), ktoré majú vysokú afinitu k katiónom. Väzbové miesta pre ión desodný sú prístupné iba v stave, keď je na endodoméne naviazaný ATP na úrovni zväčšenej slučky. Stav, v ktorom sa podjednotka viaže súčasne na ATP a na ďalšie ióny sodíka, je zahájením čerpacieho cyklu (čerpací mechanizmus nájdete nižšie) .3 Sodné čerpadlo objavil v roku 1950 dánsky chemik Jens Christian Skou, ktorý o 47 rokov neskôr, v roku 1997, získal Nobelovu cenu za chémiu za heslo poroty: „za prvý objav enzýmu transportujúceho anióny, Na +, K + -ATPáza“. Názov Na +/K + -ATPáza je spôsobený skutočnosťou, že enzymaticky štiepi ATP na energiu potrebnú na antientropický transport. 82
1 000 kDa [38]. Napokon na úrovni eukaryotických buniek existuje aj typ F ATPáz (s F z „fosforilačného faktora“), ktorý syntetizuje ATP pomocou energie pochádzajúcej z rozptýlenia existujúceho protónového gradientu na membráne. 85
100 kDa) a dve menšie podjednotky ( a , z
25 nm bunkovej membrány; 3. Priblíženie vezikúl (v angličtine „vesicles docking“) k bunkovej membráne, to znamená ich vzdialenie od 5 do 10 nm (hrubé ako membrána) medzi dvoma membránami (bunkovými, respektíve vezikulárnymi); 4. Primikulácia vezikúl, ktorá zahŕňa sériu udalostí súvisiacich s prešmykmi bielkovín a lipidov závislých od ATP a Ca2 +, prešmykmi potrebnými na vykonanie posledného kroku. (Zdá sa, že pri konštitutívnej exocytóze toto štádium neexistuje.); 5. Fúzia vezikúl s bunkovou membránou a vylúčenie sekrečných produktov [70]. Fúziu uskutočňujú niektoré proteíny, ktoré sa nazývajú skrátene SNARE (z „S oluble N-etylmaleimid-senzitívneho proteínu REc eptora“), ktoré sú v -SNARE (v membráne vezikúl) a t-SNARE (v membráne intint , s t z vášho anglického jazyka). Je potrebné spomenúť, že interakcie založené na komplementarite v-SNARE/t-SNARE sú tiež dôležité pre javy, ktoré prebiehajú v predchádzajúcich fázach. Zdá sa, že čo sa stane s membránami sekrečných vezikúl, závisí od typu exocytózy. Pri konštitutívnej exocytóze sa pripúšťa opotrebenie membrán 96