Národné; miestne spolupráce Inštitút Maxa Plancka pre imunobiológiu a epigenetiku
Okrem grantov od spoločnosti Max Planck Society boli vedci z Inštitútu Maxa Plancka pre imunobiológiu a epigenetiku opakovane úspešní v výberových konaniach federálneho ministerstva školstva a výskumu (BMBF) a Nemeckej výskumnej nadácie (DFG), takže tieto ústredné inštitúcie pre Podpora vedy a výskumu v Nemecku je dôležitým zdrojom financovania inštitútu.
Väčšina výskumných skupín ústavu aktívne spolupracuje s partnermi na univerzite vo Freiburgu, najmä prostredníctvom špeciálnych výskumných oblastí (SFB) a výskumného klastra financovaného z DFG v rámci Iniciatívy excelentnosti.
Osobitnou silou týchto spoluprác je transdisciplinárne prepojenie základného výskumu a translačného výskumu medzi Maxom Planckom a miestnymi partnermi z univerzity a univerzitnej kliniky. Okrem toho tieto spolupráce poskytujú úrodnú pôdu pre podporu mladých vedcov, ako ukazuje príklad Medzinárodnej výskumnej školy Max Planck Research School (IMPRS-IEM) alebo Spemann Graduate School.
Tieto rôznorodé synergie predstavujú dôležitý impulz pre vedecké aktivity na ústave a prispievajú k obohateniu dlhodobej udržateľnosti výskumného prostredia nielen v rámci MPI-IE, ale aj v širšej freiburskej vedeckej komunite.
Nemecká výskumná nadácia (DFG) financuje výskumné projekty v mnohých odborných oblastiach. Zahŕňa to financovanie jednotlivých projektov, oblastí špeciálneho výskumu (SFB), vysokých škôl a podporu vedeckej infraštruktúry.
Collaborative Research Centers (SFB) sú dlhodobé výskumné inštitúcie na univerzitách, v ktorých vedci spolupracujú naprieč rôznymi odbormi a spoločne uskutočňujú výskum. MPI-IE, univerzita a Fakultná nemocnica vo Freiburgu úzko spolupracujú už celé desaťročia. Na univerzite existuje množstvo oblastí špeciálneho výskumu s účasťou výskumných skupín z MPI-IE. V jednom variante programu „SFB Transregio“ až tri univerzity a neuniverzitné výskumné ústavy spolupracujú na dosiahnutí spoločného výskumného cieľa.
Tu nájdete výber projektov financovaných z DFG, ktoré boli alebo budú realizované v ústave:
CRC 1425 „Heterocelulárna podstata srdcových lézií“
SFB 1425 „Heterocelulárna podstata srdcových lézií: identity, interakcie, dôsledky“ skúma nemyocyty v srdci, ako sú spojivové tkanivo a imunitné bunky alebo neuróny, ktoré sú rozhodujúcimi faktormi ovplyvňujúcimi štrukturálnu a funkčnú integráciu srdca v homeostáze a chorobe. Zameriava sa na výskum základných mechanizmov a relevantnosti interakcií medzi bunkami a na využitie týchto poznatkov na riadenie procesov opravy s cieľom identifikovať potenciálne ciele NM pre terapeutické intervencie. Je potrebné vyvinúť nové metódy diagnostiky a liečby srdcových chorôb. Nejde v prvom rade o vyhýbanie sa alebo transformáciu jaziev, ale skôr o to, aby sa umožnilo cieleným spôsobom množiť „lepšie jazvy“. DFG GEPRIS
CRC 1381 „Dynamická organizácia mechanizmov bunkových proteínov“
SFB 1381 „Dynamická organizácia bunkových proteínových strojov: od biogenézy a modulárneho zostavenia po funkciu“ skúma, ako sa rôzne proteíny dynamicky skladajú do zložitých multimérov, takzvaných proteínových strojov. Tieto procesy hrajú úlohu v energetickom metabolizme bunky, v replikácii, oprave a transkripcii DNA, skladaní a degradácii proteínov a v intra- a medzibunkových komunikačných a transportných procesoch. Dôraz je kladený na organizáciu týchto proteínových strojov do modulárnych jednotiek, reguláciu ich konštrukcie a rozkladu a vplyv týchto procesov na bunkové funkcie. Cieľom SFB 1381 je definovať a pochopiť dynamické procesy štruktúry a organizácie bunkových proteínových strojov a tým získať prehľad o základných procesoch živej bunky. DFG GEPRIS
Zúčastnení výskumní pracovníci: Asifa Akhtar, Valérie Hilgers
SFB 1160 „IMPATH“
SFB 1160 »Imunopatológia z dôvodu obmedzených imunitných reakcií (IMPATH)« je výskumná iniciatíva klinických imunológov a základných výskumníkov, ktorí chcú spochybniť tradičnú myšlienku, že pre imunitne sprostredkovanú patológiu je rozhodujúca „nadmerná reakcia“ alebo „odchýlka“ normálnych imunitných reakcií. imunosupresia je vhodnou terapeutickou stratégiou pre tieto poruchy. Namiesto toho je koncepčným základom SFB myšlienka, že narušené imunitné reakcie sú dôležitým predpokladom imunopatológie. DFG GEPRIS
Zúčastnení výskumní pracovníci: Thomas Boehm, Edward Pearce
SFB 1140 "KIDGEM"
SFB 1140 „Ochorenia obličiek - od génov k mechanizmom (KIDGEM)“ má za cieľ analyzovať gény spojené s ochoreniami obličiek a previesť funkciu génov do porozumenia molekulárnej fyziológie obličiek. Na dosiahnutie systematického a integrovaného prístupu k dedičným chorobám obličiek združila spoločnosť KIDGEM konzorcium lekárov a vedcov. Prostredníctvom širokého spektra techník a zvieracích modelov, ako aj prístupu k pacientom by objasnenie patologických molekulárnych mechanizmov malo uľahčiť diagnostiku, liečbu a prevenciu dedičných ochorení obličiek. DFG GEPRIS | 🔴 Finančné obdobie: 2015 až 2019
Zúčastnení výskumní pracovníci: Asifa Akhtar
SFB 992 „MEDEP“
SFB 992 „Lekárska epigenetika (MEDEP) - od základných mechanizmov po klinické aplikácie“ je prekladový program pre epigenetický výskum, ktorý sa pohybuje od identifikácie základných epigenetických princípov a validácie epigenetických dráh v príslušných zvieracích modeloch pre ľudské choroby až po transláciu epigenetických princípov do klinických. Aplikácií je dosť. Popri možnostiach hĺbkového sekvenovania a bioinformatiky na vytváranie a analýzu epigenetických profilov ponúkajú základné infraštruktúry aj platformu pre návrh epigeneticky účinných liekov. MEDEP sleduje doplnkový a interdisciplinárny prístup, ktorý preklenuje priepasť medzi základným výskumom a klinickým výskumom. DFG GEPRIS
SFB 850 "Kontrola motility buniek v morfogenéze, invázii nádorov a metastázach"
Výskumný program SFB 850 »Riadenie bunkovej motility v morfogenéze, invázii nádorov a metastázach« je založený na koncepcii, že väčšina signálnych dráh riadiacich normálny vývoj embryí je v ľudských nádoroch nesprávne zameraná. Preto analýza funkcie a regulácie týchto signálnych dráh počas vývoja pomôže pochopiť mechanizmy, ktoré sú podkladom patologickej bunkovej motility pri rakovine. DFG GEPRIS
SFB 746 „Funkčná špecifickosť prostredníctvom väzby a modifikácie proteínov“
Ústredným cieľom SFB 746 „Funkčná špecificita prostredníctvom väzby a modifikácie proteínov“ je pochopiť procesy multiproteínových komplexov a proteínových sietí a ako vybaviť určitú bunku jej mimoriadne presnými a vysoko špecifickými funkciami. Výskumné tímy SFB 746 analyzujú molekulárne mechanizmy, ktoré stoja za špecifickosťou proteínových komplexov a sietí a ich význam pre bunkové funkcie. DFG GEPRIS | 🔴 Finančné obdobie: 2007 až 2018
SFB 620 „Imunodeficiencia: Klinické a zvieracie modely“
SFB 620 „Imunodeficiencia: Kliniky a zvieracie modely“ skúmal imunodeficienciu u ľudí a na zvieracích modeloch. Cieľom bolo lepšie porozumieť imunobiologickým a molekulárno-genetickým vzťahom pri vývoji porúch imunitného systému. Vedci sa zamerali na T bunky a B bunky vrátane vývoja nových zvieracích modelov na zlepšenie klinickej diagnostiky a nových terapeutických prístupov. Ďalšie projekty pracovali na rozhraní medzi zvieracími modelmi a klinickým pozorovaním, teda či experimentálne nálezy na zvieratách rýchlo naznačujú ich použitie u pacientov. Klinické otázky navyše viedli k bunkovým biologickým a genetickým vyšetreniam s ľudským bunkovým materiálom. DFG GEPRIS | 🔴 Finančné obdobie: 2002 až 2013
SFB 592 „Signalizačné mechanizmy v embryogenéze a organogenéze“
SFB 592 „Signálne mechanizmy v embryogenéze a organogenéze“ skúmal základné mechanizmy, ktoré sa podieľajú na formovaní embryonálneho profilu, ako aj na diferenciácii a morfogenéze orgánov. Paralelne boli skúmané živočíšne aj rastlinné systémy, pretože mnohé systémy majú spoločné základné aspekty signálnych mechanizmov, ako je tvorba zdrojov signálu, riadenie rozsahu signálu a mechanizmy prenosu signálu. DFG GEPRIS | 🔴 Finančné obdobie: 2001 až 2012
SFB Transregio/TRR
TRR 130 "B bunky: imunita a autoimunita"
Transregio-SFB 130 »B bunky: Imunita a autoimunita» skúma, ako sú B bunky aktivované, ako diferencujú a produkujú protilátky a ako sa tieto bunky vo vysokej miere uvoľňujú po dlhšiu dobu. Cieľom vedcov je lepšie pochopiť, ako sa vyvolávajú imunitné reakcie B-buniek, ako sa eliminujú samovoľne reagujúce B-bunky a ako sa B-bunkám darí útočiť na patogény, ktoré už majú. “ odvolať “. DFG GEPRIS
TRR 167 "NeuroMac"
Cieľom TRR 167 „Vývoj, funkcia a potenciál myeloidných buniek v centrálnom nervovom systéme (NeuroMac)“ je získať prehľad o rôznych funkciách myeloidných buniek v CNS počas vývoja, zdravia a chorôb. Osobitné zameranie bude na parenchymálne makrofágy, cirkulujúce monocyty a myeloidné bunky kostnej drene. Kombinácia štúdií o vývoji a homeostáze myeloidných buniek v mozgu, neurobiológie, bunkovej migrácie a neuropatológie v jednej výskumnej iniciatíve umožní produktívnu a plodnú interakciu medzi rôznymi zúčastnenými skupinami. DFG GEPRIS
Vedecké vzdelávanie
Každý, kto skúma spolu, musí aj učiť. Ďalším zameraním spolupráce medzi MPI-IE a Univerzitou vo Freiburgu je školenie mladých vedcov v obidvoch inštitúciách. Na výučbe sa podieľa množstvo výskumných skupín a riaditeľov MPI-IE, ktorí sú zvyčajne úzko spojení s biologickou a lekárskou fakultou univerzity. Výskumné skupiny MPI-IE sú tiež zapojené do medzinárodného doktorandského programu MPI-IE. Max Planck Research School for Immunobiology, Epigenetics and Metabolism (IMPRS-IEM) je spoločný vzdelávací program MPI-IE a University of Freiburg.
IMPRS-IEM je Medzinárodná výskumná škola Maxa Plancka, ktorá sídli na MPI pre imunobiológiu a epigenetiku v spolupráci s univerzitou vo Freiburgu. Doktorandský program ponúka talentovaným mladým výskumníkom vynikajúce možnosti odbornej prípravy v oblasti imunobiológie, epigenetiky, metabolizmu, bunkovej biológie, biochémie, proteomiky, bioinformatiky a funkčnej genomiky. Medzi výhody pre mladých vedcov patrí priekopnícky výskum, najnovšie technológie v základných zariadeniach ústavu a náročné učebné osnovy pre tie nezávislé mysle, ktoré sa v budúcnosti chcú ujať vedúcich pozícií vo vede.
Na univerzitách sa zriaďujú postgraduálne vysoké školy na podporu mladých vedcov. Sú financované zo zdrojov DFG až na deväť rokov. Dôraz sa kladie na kvalifikáciu doktorandov ako súčasť cieleného výskumného programu a štruktúrovanej stratégie školenia. Vedci z MPI-IE sú zapojení do fakúlt dvoch freiburgských postgraduálnych škôl.
Spemannova postgraduálna škola biológie a medicíny bola založená v roku 2006 ako súčasť Iniciatívy excelentnosti DFG a ponúka interdisciplinárne doktorandské vzdelávanie z rôznych disciplín, ktoré kombinuje základný výskum s translačným výskumom, biotechnológiami a vývojom liekov. Spemann Graduate School bola založená v úzkej spolupráci s ostatnými postgraduálnymi školami na univerzite vo Freiburgu a IMPRS-IEM. Niektorí vedci z MPI-IE sú aktívnymi členmi fakulty Spemann Graduate School.
„MeInBio - BioInMe: Skúmanie časopriestorovej dynamiky regulácie génov pomocou metód s vysokou výkonnosťou a vysokým rozlíšením“ je štruktúrovaný doktorandský program (postgraduálna vysoká škola) na univerzite vo Freiburgu a MPI pre imunobiológiu a epigenetiku. V spoločnosti MeInBio sa prírodné vedy a bioinformatika spojili, aby porozumeli regulácii génov. Doktorandi z celého sveta pracujú v rôznych výskumných skupinách - vo vlhkom laboratóriu aj v bioinformatike a štatistických skupinách - na prehĺbení porozumenia kontroly transkripcie pomocou vysokého priestorového a časového rozlíšenia. Práce na výskumnom projekte sú doplnené konkrétnym kvalifikačným programom. MeInBio je financovaný z prostriedkov DFG od roku 2017 a jeho cieľom je vytvoriť vynikajúce podmienky pre doktorandské štúdium a vytváranie vedeckých sietí. Aktuálnymi členmi fakulty MeInBio sú: Dominic Grün, Eirini Trompouki, Thomas Manke
Základné zariadenia MIAP
DFG podporuje rozvoj výskumnej infraštruktúry a spoločné využívanie technológií svojou finančnou líniou „Centrá zariadení - základné zariadenia“. Zobrazovacie zariadenie MPI-IE je členom „Platformy pre mikroskopiu a analýzu obrazu (MIAP) Freiburg“, ktorá bola založená v roku 2016 s cieľom vytvoriť vysokovýkonnú sieť pre vedeckú infraštruktúru zobrazovacích ložísk prírodných vied vo Freiburgu, Bazileji a Štrasburgu. MIAP podporuje bio vedcov pri hľadaní zdrojov a pri vývoji experimentálnych pracovných procesov podľa biologických problémov. Ďalej sú vypracované pokyny pre školenie používateľov, školenie, plánovanie a monitorovanie projektu a sú ponúkané pravidelné série workshopov a seminárov v danej oblasti.
Ostatné projekty
Atlas ľudských buniek
„Atlas ľudských buniek“ Cell Atlas je významný vedecký projekt, ktorý v októbri 2016 zahájili poprední medzinárodní vedci s cieľom dešifrovať všetky všetky typy ľudských buniek. Atlas má poskytnúť presný prehľad o tom, ktoré gény, proteíny a ďalšie molekuly sú aktívne v ktorom bunkovom type, kde presne sa bunky nachádzajú, ako bunky vzájomne pôsobia v zdravom tele a ktoré zmeny nastávajú v bunkách, keď dôjde k ochoreniu organizmu. Projekt Human Cell Atlas je čiastočne financovaný z iniciatívy zakladateľa Facebooku Marka Zuckerberga a jeho manželky Priscilly Chan a zahŕňa nielen mapovanie ľudských buniek, ale jeho cieľom je aj ďalší vývoj experimentálnych technológií a metód počítačovej analýzy s cieľom rozvíjať hlbšie porozumenie ľudskej biológie. Projekt Dominika Grüna a jeho laboratória z Freiburgu je súčasťou Atlasu ľudských buniek.
Hlboko nemecký program epigenómu
MPI-CSL
MPI-IE tiež organizuje početné interné a externé akcie pre kolegov z Inštitútu Maxa Plancka pre výskum kriminality, bezpečnosti a práva vo Freiburgu (MPI-CSL).