Rozdiely vo vývoji obezity vyvolanej stravou v subkmeňoch C57BL6 - PDF

1 Rozdiely vo vývoji obezity vyvolanej stravou v kmeňoch C57BL/6 Vyšetrovanie fenotypových a genetických rozdielov v kmeňoch C57BL/6 DISZERTÁCIA predložená Lekárskej fakulte Univerzity v Lipsku na získanie akademického titulu DOCTORUM RERUM MEDICINARUM (Dr. rer. Med.) autor: narodil sa v produkcii Školiteľ: Diplomový biológ Matthias Kern 31. júla 1980 v Lipsku apríl 2012 na lipskej univerzite, klinika a poliklinika pre endokrinológiu a nefrológiu prof. Dr. med. Matthias Blüher Rozhodnutie o udelení doktorátu od: 16. októbra 2012

vývoji

3 3 Obsah OBSAH 3 BIBLIOGRAFICKÝ POPIS 4 1. ÚVOD K TÉME Definícia a epidemiológia obezity Vývoj obezity Vzory distribúcie tukov a ovplyvňujúce faktory 6 2. VZOR ZVIERAT ZVIČATOSTI Krysa tučného cukru (ZFR) NZ Krysa mastného tuku Wistar (Wistar Nový Zéland) ag ) Myš Kuo Kondo (KK) Myš db/db Myš ob/ob Myš C57BL/6 Obezita vyvolaná látkami a stravou SNP JEDNOTNÝ NUKLEOTIDOVÝ POLYMORFIZMUS CIEĽ PRÁCE ZVEREJNENIE SÚČASNEJ PRÁCE ZHRNUTIE ZHRNUTIE LITERATÚRA Príloha Príprava práce

15 15 Význam medzi molekulárnymi genetikmi. SNP sú bohaté a stabilnejšie ako STR kvôli nízkej miere mutácií. V medzinárodných databázach existuje veľa referenčných sekvencií (NCBI HapMap Ensembl, na základe ktorých je možné identifikovať SNP, ktoré sa našli počas sekvenovania. Je tiež možné určiť, či ide o bežný štandardný variant alebo možnú variantu relevantnú pre ochorenie. Genotypizáciu SNP možno použiť na skúmanie týchto genetických variácií u väčších populácií a na štatistickú analýzu fenotypovo súvisiacich. 4. Cieľ práce Kmeň C57BL/6 sa široko používa ako kontrolný kmeň pre štúdie obezity vyvolané stravou. Cieľom tejto štúdie bolo zistiť, či i) dva podkmene C57BL/6, C57BL/6NTac a C57BL/6JRj, sa líšia, pokiaľ ide o prejav obezity vyvolanej stravou, a ii ) či existujú genetické rozdiely medzi podsystémom muži tam.

16 5. Publikácia tejto práce 16

24 24 indukovaná obezita a geneticky najmenej u 11 SNP. Poznatky získané z tejto štúdie ukazujú, aké dôležité je zvoliť pre každú novú otázku najvhodnejšie modelové zviera. A nakoniec, táto štúdia zdôrazňuje dôležitosť nepretržitého monitorovania genetického pozadia a stavu kmeňa nielen u myší C57BL/6.

34 Diwan BA a Blackman KE. Diferenciálna citlivosť 3 sublínových myší C57BL/6 na indukciu kolorektálnych nádorov 1,2-dimetylhydrazínom. Cancer Lett: Roth DM, Swaney JS, Dalton ND, Gilpin EA a Ross Jr. Dopad anestézie na funkciu srdca počas echokardiografie u myší. Na. J. Physiol. J Srdce Circ. Physiol. 282: H2134-H Botstein D, White RL, Skolnick M a Davis RW. Konštrukcia mapy genetickej väzby u človeka pomocou polymorfizmu dĺžky reštrikčných fragmentov. Na. J. Hum. Genet, Nicholson A, Reifsnyder PC, Malcolm RD, Lucas CA, MacGregor GR, Zhang W, vedúci EH. Diétou indukovaná obezita v dvoch subkmeňoch C57BL/6 s intaktným alebo mutantným génom nikotínamid nukleotid transhydrogenázy (Nnt). Obezita (Silver Spring) Oct; 18 (10): Epub 2010 Jan Bailey D. Aké čisté sú inbredné kmene myší, Immunol. Dnes pp Mulligan MK, Ponomarev I, Boehm II SL, Owen JA, Levin PS, Berman AE a kol. Alkoholické vlastnosti a transkripčná genomická analýza substrátov C57BL/6, Genes Brain Behav, pp

35 35 8. Prílohy 8.1 Životopis Osobné údaje Meno: Kern Meno: Matthias Dátum narodenia: 31. júla 1980 Miesto narodenia: Lipsko Štátna príslušnosť: nemčina Študijný program 02/2012 Konečné spracovanie vedeckej práce na získanie akademického titulu Doctor rerum medicinarum (Dr. rer. Med .), Medical Clinic III, University of Leipzig 11/2011 doktorand pod vedením prof. Dr. med. M. Blüher, Medical Clinic III, University of Leipzig a Dr. N. Klöting, IFB Obesity Diseases, NWG2 Animal Models of Obesity, University of Leipzig 09/2006 Diplomová práca pod vedením Prof. Dr. med. M. Blüher a Dr. N. Klöting, Medical Clinic III, University of Leipzig 10/2006 Biology Studies, University of Leipzig Funding 1. formula.1 Program Lekárskej fakulty univerzity v Lipsku 01/2010, Úloha genetickej variácie v géne iniciátora replikácie 1 (Repin1) Obezita a hypertriglyceridémia, Deutsche Diabestes Gesellschaft (DDG) 02/2009 Vyšetrovanie interakcií medzi podkožným a viscerálnym tukovým tkanivom, 7000