Nová testovacia metóda dokáže detekovať koronavírus vo silne zriedených vzorkách kloktadla - Biermannova medicína
Farmaceutom na Univerzite Martina Luthera v Halle-Wittenberg (MLU) sa podarilo pomocou hmotnostnej spektrometrie zistiť najmenšie množstvá koronavírusu SARS-CoV-2.
Na svoje vyšetrovanie použili riešenia, s ktorými kloktali ľudia s COVID-19. V budúcnosti by nová metóda mohla slúžiť ako doplnok k predtým bežným testom. Teraz sa ďalej vylepšuje, aby bol k dispozícii ako štandardný diagnostický nástroj. Prvé výsledky boli zverejnené v časopise „Journal of Proteome Research“.
Ak chcete s istotou zistiť, či je niekto akútne chorý na COVID-19, v súčasnosti existuje najmä jedna spoľahlivá testovacia metóda: polymerázová reťazová reakcia alebo skrátene PCR. Zisťuje genetickú výbavu vírusu, a preto je veľmi špecifický. Iné testy naopak zvyčajne detekujú protilátky proti chorobe - telo ich však produkuje iba v priebehu infekcie, takže slúžia iba na zistenie prekonaného alebo prekonaného ochorenia. Testy na protilátky sú tiež často nešpecifické a niekedy nemôžu rozlíšiť rôzne koronavírusy, ktoré sa môžu vyskytnúť u ľudí. Testovacie laboratóriá na celom svete preto dosahujú hranicu svojich kapacít.
Prof. Dr. Andrea Sinz, expertka na hmotnostnú spektrometriu z Farmaceutického ústavu na MLU, dostala nápad vyvinúť nový test založený na hmotnostnej spektrometrii, ktorý by doplnil PCR. Hmotnostná spektrometria umožňuje presnú identifikáciu molekúl na základe ich hmotnosti a náboja. Sinz a jej kolegovia vyvinuli metódu na hľadanie zložiek vírusov SARS-CoV-2. „Priamo meriame peptidy, ktoré pochádzajú z vírusu, a nie genetický materiál,“ vysvetľuje Sinz.
Univerzitné lekárske centrum v Halle poskytlo pre experimenty klokotavé riešenie od troch pacientov s COVID-19. Pracovná skupina Sinz ‘vyvinula metódu identifikácie vírusových zložiek vo vysoko zriedených vzorkách. „Aj keď sme dostali iba trochu kloktacieho roztoku, podarilo sa nám nájsť zložky vírusových proteínov,“ hovorí Dr. Christian Ihling, ktorý testy vykonal.
„To bolo dosť prekvapujúce, nečakal som, že to naozaj bude fungovať aj sám,“ dodáva Sinz. Test je vysoko špecifický pre vírus, pretože zodpovedajúce proteíny sa nachádzajú iba v SARS-CoV-2. Okrem toho sa dá použiť na dobré testovanie v počiatočnej fáze ochorenia, keď je v ústach a hrdle veľa vírusov.
Test sa dá v súčasnosti vykonať asi za 15 minút, tvrdí Sinz. Pracovná skupina sa teraz snaží časy analýzy ešte ďalej skrátiť. V súčasnosti na to používa umelo vyrobené vírusové komponenty. Sinz tiež hľadá ďalšie spolupráce, a to aj s priemyslom. „S firmou z Hesenska chceme použiť inú hmotnostnú spektrometrickú metódu, pri ktorej je možné merania vykonať v priebehu niekoľkých sekúnd,“ hovorí farmaceut.
Táto metóda by potom bola porovnateľná s takzvaným „biotypovaním“, ktoré je už zavedené na klinikách pre diagnostiku bakteriálnych alebo plesňových infekcií. Musí sa však ešte preukázať, či je tento prístup vhodný na detekciu SARS-CoV-2. Príprava vzorky by potom nebola namáhavá a merania by mohli vykonávať aj nešpecializovaný personál.
Nová diagnostická metóda s hmotnostnými spektrometrami zatiaľ nebude k dispozícii okamžite. Sinz dúfa, že bude o niekoľko mesiacov pripravená na akciu: „Mám úzku výmenu s kolegami z celého sveta, z ktorých niektorí mali oveľa horšiu pandémiu ako tu.“ Je tiež zakladajúcou členkou „Koalície pre hromadnú spektrometriu COVID-19“., výskumná skupina, ktorej cieľom je lepšie pochopiť ochorenie pomocou hmotnostnej spektrometrie.