Nový spôsob štiepenia bielkovín

Vedci pomocou konkrétneho proteínu vyvinuli efektívnejší a efektívnejší spôsob štiepenia proteínov. To by mohlo otvoriť nové terapeutické možnosti pre choroby.

Z

nový
Alexander Joppich Publikované: 17.11.2017, 12:28

Trim-Away ničí fluorescenčný proteín vo vaječnej bunke. Zľava: bunka pred zavedením protilátok proti proteínu a o 10 minút neskôr.

GÖTTINGEN/CAMBRIDGE. Vedcom sa podarilo vyvinúť novú metódu na rýchle zastavenie produkcie bielkovín v bunkách. Uvádzajú, že v časopise „Cell“ (doi: 10.1016/j.cell.2017.10.033 (2017)).

Nová metóda TrimAway sa zameriava na rovnomenný proteín Trim21: ktorý rozpoznáva protilátky viazané na vírusy v tele a označuje tieto komplexy na degradáciu proteazómom likvidujúcim odpad. Vedcom sa teraz podarilo dostať do bunky protilátky, ktoré nie sú namierené proti vírusu, ale proti konkrétnemu proteínu. Potom, čo bol proteín označený Trim21, organizmus podľa vedcov zničil spojenie proteín-protilátka v priebehu niekoľkých minút.

Môže sa použiť aj na biele krvinky

Výhodou ich novej metódy v porovnaní s interferenciou RNA s génovými nožnicami CRISPR-Cas9 a RNA je, že TrimAway pracuje aj s dlhočiznými proteínmi a v primárnych bunkách, t. J. Bunkách odobratých priamo z tkaniva. Keďže dve staršie metódy začínajú v genóme, ovplyvňovali tvorbu bielkovín iba nepriamo - na rozdiel od TrimAway, ktorý funguje priamo na úrovni bielkovín.

Je tiež možné štiepiť proteíny v makrofágoch. „Makrofágy sú pre CRISPR-Cas9 a RNAi úplne neprístupné, pretože sú obzvlášť dobré v rozpoznávaní cudzej DNA a RNA a sú to ústredné súčasti týchto techník,“ vysvetľuje Dr. Leo James z MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge. Pretože TrimAway umožňuje túto degradáciu, bolo možné skúmať funkciu jednotlivých proteínov v makrofágoch.

Možná možnosť terapie

Vaša nová metóda by sa mohla použiť aj na terapeutické účely, pretože je možné rozlíšiť rôzne varianty toho istého proteínu. V teste vedci použili TrimAway na odstránenie chorobne spôsobujúceho variantu Huntingtonovej choroby z buniek tkanivových kultúr. Podobný, zdravý proteín však zostal nedotknutý.

„Samozrejme, robiť to v bunkovej kultúre je niečo úplne iné ako liečiť chorobu,“ hovorí Dr. Melina Schuh z Inštitútu Maxa Plancka pre biofyzikálnu chémiu. „Ale naša práca otvára v budúcnosti nové možnosti liečby chorôb protilátkami.“