Omic technologies, hlavný vývoj vo výskume výživy hospodárskych zvierat - Revista
Používanie omických techník na skúmanie účinkov problémov a liečby na zvieratách na molekulárnej úrovni je hlavným problémom výskumu výživy zvierat, ako ukazuje štúdia zverejnená na túto tému spoločnosťou AllAboutFeed, ktorú podpísala Dr. Martha Kluneman-výskumná manažérka pre výživu Imunológia Evonik.
Systematické poznanie
Tieto nové typy analýz umožňujú oveľa hlbšie systematické znalosti o biológii živočíchov a ich interakciách s potravinami, ale prinášajú aj nové výzvy. nejde o prírodovedné pole, ale o súbor metód používaných na meranie experimentálnych predmetov v konkrétnych výskumných témach.
V jadre sú techniky Omice zamerané na meranie celkového zloženia špecifickej biochemickej skupiny: (meta) genomika pre DNA, transkriptomika pre RNA, proteomika pre proteíny, metabolomika pre malé hydrofilné zlúčeniny a lipidomika pre malé lipofilné zlúčeniny.
Použité analytické metódy určujú fyzikálno-chemické vlastnosti sledovaných chemických entít. Preto v Omicsu existuje rozdelenie medzi metódami založenými na sekvenovaní pre DNA a RNA a najmä metódami založenými na hmotnostnej spektrometrii pre proteíny, metabolity a lipidy.
Súbor metód
Omic technológie nie sú oblasťou vedy, ale skôr súborom metód používaných na meranie experimentálnych predmetov v konkrétnych výskumných otázkach.
Avšak vo všetkých metódach sa schopnosť merať veľa molekúl obchoduje so schopnosťou merať absolútnu koncentráciu týchto molekúl. Dodatočné vyrovnania predstavujú obmedzenú citlivosť pre metódy založené na sekvenovaní a nižšiu presnosť pre metódy založené na hmotnostnej spektrometrii v porovnaní s ich cieľovými náprotivkami.
Najmä kvôli množstvu generovaných údajov v porovnaní s klasickými analytickými metódami je vizualizácia údajov a výsledkov pomocou grafov nevyhnutným krokom pri akejkoľvek analýze údajov Omics. Typicky sa na preskúmanie všeobecných rozdielov medzi vzorkami a na preukázanie účinku experimentálneho pôsobenia na skúmanú entitu Omics používa analýza hlavných komponentov (PCA) alebo analýza hlavných súradníc (PCoAs).
Génová klasifikácia
Pre štatisticky významné účinky sú vzorky tepla užitočné ako pomôcka pri výbere zaujímavých molekulárnych vzorov. Vedci navyše klasifikujú gény a ďalšie molekuly podľa pridruženej funkcie, ktorú už predtým opísali iní vedci a zhromaždili ju v databázach.
Molekula je často zapojená do mnohých procesov a proces pozostáva z niekoľkých molekúl. Tieto vzťahy medzi mnohými sťažujú interpretáciu údajov, ale starostlivým zvážením biologického kontextu môžu tieto asociácie dráh viesť výskumníka k užitočnej a testovateľnej hypotéze o vnútornej práci skúmaných vzoriek.
Základné uskutočnenie omickej technológie je, že fenotypové pozorovanie zložených pozorovateľných znakov alebo charakteristík organizmu) možno v štúdii na zvieratách kombinovať s meraniami väčšiny molekúl, ktoré tvoria biologické prostredie vo vzorke. Vizuálne a iné známe rozdiely medzi vzorkami teda môžu podporiť interpretáciu omických výsledkov a môžu viesť k záveru, ktorý vysvetľuje molekulárny mechanizmus, ktorý určuje fenotyp.
Nástroj pre výskumných pracovníkov
Aj keď metódy „Omics“ poskytujú predstavu o tom, ako sa mení celý skúmaný biologický systém, nie je najlepšou voľbou ukázať, ako sa mení konkrétna časť systému.
Cieľové metódy alebo nový cielený experiment teda musia dopĺňať klasické testy s metódami Omice, aby bolo možné otestovať hypotézy zo samotných výsledkov Omice.
Okrem toho metódy Omice nemôžu nahradiť fenotypový nález, ako je lepší pomer premeny krmiva alebo rýchlejšia odpoveď na očkovanie, ale môžu viesť výskumníka k cielenej, testovateľnej hypotéze o základnom molekulárnom mechanizme.