Poruchy v zažívacom trakte - MyMicrobiome
Známym prípadom narušeného biotopu v našom tele je hnačka spojená s antibiotikami. Črevný ekosystém je spočiatku ničený nešpecifickými antibiotikami, takže naše črevá stratili veľa dôležitých nástrojov pre zdravé trávenie a chýbajú tiež zbrane, ktoré črevo bojuje proti patogénnym útočníkom. Exponované oblasti na vnútorných stenách čreva sú dnes dokonalým prostredím na kolonizáciu patogénnych zárodkov. Jedným z najbežnejších a najnebezpečnejších zárodkov pri hnačkách spojených s antibiotikami je Clostridium difficile, ktorý poškodzuje našu črevnú sliznicu a spôsobuje zápal uvoľňovaním dvoch veľmi silných toxínov.

Obezita
Mikrobiálne zloženie v našom zažívacom trakte ovplyvňuje našu chuť do jedla a schopnosť ukladať tuk.
Baktérie, ktoré sa nachádzajú v našom žalúdku, nazývané Helicobacter pylori, nám dávajú vedieť, či sme hladní alebo plní. Okrem regulácie obsahu kyselín v žalúdku spôsobuje táto baktéria pokles hormónu ghrelinu, ktorý sa podieľa na regulácii chuti do jedla. Ak táto baktéria chýba, dochádza k zvýšenej produkcii grelínu a tým k väčšej chuti do jedla.
H. pylori si, bohužiaľ, za posledných niekoľko desaťročí nevyznal dobre, že by u vnímavých jedincov spôsoboval žalúdočné vredy; baktéria bola takmer úplne eliminovaná v našich žalúdkoch antibiotikami.
Napríklad ak bolo pred dvoma až tromi generáciami nositeľmi H. pylori 80% občanov USA, v súčasnosti je týmto zárodkom menej ako 6% amerických detí. pylori, čo môže vysvetľovať zvýšenú mieru obezity v Spojených štátoch. Zároveň sa desaťkrát zvýšila miera predtým veľmi zriedkavého typu rakoviny pažeráka.
Zloženie baktérií v našich črevách ovplyvňuje aj množstvo kalórií, ktoré prijímame z potravy. V minulosti, keď bolo jedla málo, mali ľudia s mikrobiómom, ktorý dokázal ukladať viac tukov z potravy, väčšiu výhodu prežitia. V dnešnej dobe, keď je jedlo ľahko dostupné, tieto typy mikrobiómov indukujú obezitu. Dvaja ľudia, ktorí jedia to isté, môžu a nemusia priberať na rovnakom množstve, v závislosti od toho, ako ich mikrobióm dokáže využiť zdroj uhlíka.
Na druhej strane jedlo, ktoré jeme, môže mať vplyv aj na náš mikrobióm. Ak sa pozriete na mikrobióm ľudí, ktorí žijú napríklad v Japonsku, kde sa konzumuje viac rastlinnej potravy, nájdete v čreve viac baktérií, ktoré tieto zdroje uhlíka na báze rastlín dokážu dobre využiť. Jednostranná strava s jedlom s vysokým obsahom tukov súčasne znižuje objem črevného mikrobiómu a podporuje množenie baktérií, ktoré podporujú rýchle ukladanie tukov.
Rakovina zažívacieho traktu
Váš mikrobióm tiež hrá úlohu pri vzniku rakoviny žalúdka a hrubého čreva. Nie je to váš mikrobióm, ktorý spôsobuje rakovinu, ale to, čo konzumujete, môže spôsobiť, že sa nesprávne črevá budú vo vašich črevách cítiť dobre. Najmä západná strava (veľa mäsa a tukov v kombinácii s konzumáciou málo zeleniny) uprednostňuje také baktérie, ktoré produkujú špeciálne enzýmy a žlčové kyseliny. Tieto špeciálne enzýmy môžu prevádzať neškodné zlúčeniny na molekuly spôsobujúce rakovinu, ako sú heterocyklické amíny, ktoré konzumujeme s grilovaným mäsom. Po premene na elektrofilnú molekulu môže poškodiť vašu DNA a viesť k rakovine. Takže „jablko denne ...“
Chronické zápalové ochorenia čriev, ako je Chronova choroba a ulcerózna kolitída
Jednou chorobou, ktorá ukazuje, ako sú na sebe závislé bakteriálne druhy, je chronické zápalové ochorenie čriev (IBD). IBD je chronický, opakujúci sa zápal tráviaceho traktu, ktorý poškodzuje sliznice. Zatiaľ čo u zdravých ľudí prevládajú druhy baktérií Bacteroides a Firmicutes, u ľudí s IBD nie sú dominantné. Znížený počet liekov Firmicutes vedie k zníženiu klostrídií (skupiny IX a IV), ktoré znižujú prozápalové cytokíny uvoľňovaním kyseliny maslovej. Okrem toho sa u pacientov s IBD vyskytuje v zníženom počte baktéria Bacteroides fragilis. B. fragilis stimuluje regulačné T bunky, ktoré zabraňujú tomu, aby prozápalové T bunky nekontrolovane spúšťali zápal. Stručne povedané, z dôvodu nerovnováhy mikrobiómu u pacientov s IBD chýbajú dôležité druhy baktérií, ktoré by za normálnych okolností udržali imunitný systém na uzde, ktorý je teraz hyperaktívny a pôsobí proti vlastnému telu.