Prekvapujúci objav o HIV
Vedci sa domnievajú, že HIV alebo vírus ľudskej imunodeficiencie spôsobujúci AIDS začal infikovať ľudí v stredoafrickom regióne niekedy začiatkom 20. rokov 20. storočia a rozšíril sa na človeka od šimpanzov. Od okamihu, keď sa vírus HIV začal prenášať na človeka, uplynie minimálne 80 rokov, kým sa objaví, a preto veľká časť dynamiky mutácií, ktoré tento vírus najskôr utrpel, zostáva neznáma.
Nedávno však bol v Konžskej demokratickej republike objavený najstarší takmer kompletný genóm vírusu HIV, a to v zabudnutej vzorke tkaniva z roku 1966, takmer dve desaťročia pred oficiálnym objavením vírusu HIV, informuje Agerpres. Informácie zverejnila agentúra Live Science s odvolaním sa na štúdiu zverejnenú v najnovšom vydaní časopisu Proceedings of the National Academy of Sciences.
Vzorka tkaniva bola odobratá a konzervovaná v roku 1966, čím bol tento vírusový genóm HIV o 10 rokov starší ako doteraz najstarší známy genóm HIV (zo vzorky krvi odobratej v roku 1976 od r. Kongo).
Prečo je dôležité sledovať genetické mutácie vírusu
Takéto genómové sekvencie, ktoré pochádzajú z obdobia pred objavením sa vírusu, ktorý spôsobuje AIDS (objav, ku ktorému došlo v roku 1983), prispieva k identifikácii genetických mutácií, ktoré tento vírus utrpel. V ich poradí, tieto mutácie pomáhajú vedcom sledovať, ako sa HIV šíri a kedy začal infikovať ľudí.
Z tohto pohľadu je novoobjavená genomická sekvencia veľmi dôležitá, uvádza Sophie Gryseels, spoluautorka novej štúdie a postdoktorandka v oblasti evolučnej a výpočtovej virológie na Katolíckej univerzite v Leuvene (KU Leuven), Belgicko. Táto sekvencia zodpovedá spôsobu, akým vedci určili obdobie vzniku HIV u ľudí, uviedla vo vyhlásení pre Live Science.
„Je dobré vedieť, pretože to znamená, že naše evolučné modely, ktoré aplikujeme na vírusovú sekvenciu, fungujú dobre. Nestretla som sa s nijakým veľkým prekvapením, “podčiarkla.
Existuje niekoľko kmeňov HIV, ale podskupina zodpovedná za 95% prípadov AIDS na celom svete je HIV-1 skupina M. Koniec 32 miliónov ľudí na celom svete zomreli na AIDS od vypuknutia tejto pandémie.
A ako existuje doba najmenej 80 rokov od času, keď sa vírus HIV začal prenášať na človeka, až do jeho objavenia, veľká časť dynamiky mutácií, ktoré tento vírus najskôr utrpel, zostáva neznáma.
Keď sa vírus stal virulentným?
Matematické modely rýchlosti mutácií vírusu poskytujú určité informácie o tom, kedy začal prenos HIV z človeka na človeka, ktorý sa potom zmenil na pandémiu. Zostáva však jedna otázka: kedy a prečo sa podskupina M pre HIV-1 stala natoľko plodnou, že dokázala infikovať toľko ľudí na celom svete.?
Súčasťou tohto problému je, že matematické modely, ktoré dokážu vypočítať mieru mutácií vírusu v posledných rokoch, sú podľa Sophie Gryseelsovej oveľa menej presné, keď sa vezmú do úvahy na dlhšie časové obdobia. Súvisí to so skutočnosťou, že genetická informácia sa stráca počas dlhšieho časového obdobia. Určité vírusové kmene zmiznú jednoducho v dôsledku prirodzeného výberu alebo jednoducho v dôsledku náhodných faktorov a nezanechajú stopy po ich existencii v genómoch vírusov, ktoré v súčasnosti cirkulujú.
Pre tento dôvod, objav starodávneho vírusového kmeňa je pre paleontológov ako objav archeopteryxu. Je to chýbajúca skladačka, ako sa táto skupina vírusov v priebehu času vyvinula.
Sophie Gryseel sa pripojila k prebiehajúcemu projektu vedenému biológom Michaelom Worobeyom z Arizonskej univerzity a spolu s ďalšími výskumníkmi z Belgicka, USA a Konžskej demokratickej republiky analyzovala počas roka 1 645 vzoriek bioptických tkanív zo stredoafrického regiónu. 1958 - 1966. Odobraté vzorky sa konzervovali vo formalíne a potom sa pokryli parafínovým voskom. Potom pomocou testov PCR (podobných tým, ktoré sa používajú na detekciu nového koronavírusu), vedci hľadali stopy genómu HIV. Nakoniec objavili iba jednu takúto stopu: vírusovú sekvenciu v biopsii lymfatických uzlín od 38-ročného muža.
Prečo je nový objav dôležitý a čo musia výskumníci určiť
Existujú aj staršie vírusové fragmenty HIV - jeden z roku 1959 a druhý z roku 1960, tiež z DR Kongo. Ale toto sú čiastočné a štandardne nemôžu poskytovať informácie o mutáciách, ktoré tento vírus v priebehu času prešiel. Tieto dva fragmenty sú tiež súčasťou rôznych podtypov HIV, tvrdí Gryseels, čo to dokazuje tento vírus koluje u ľudí už pred 50. rokmi.
Ďalším cieľom vedcov je zistiť keď sa vírus HIV-1 začal rýchlo šíriť, epidémia. Podľa Sophie Gryseelsovej mohli v genóme vírusu HIV-1 dôjsť k nejakým zmenám, ktoré ho zefektívnili. Ale pravdepodobnejšie, zmeny v ľudskej spoločnosti to umožnili.
urbanizácia začiatkom 20. storočia v strednej Afrike rýchlo rástol.
V rokoch 1910 až 1950 boli k dispozícii kampane v oblasti verejného zdravia liečby pri stavoch, ako je malária, poruchy spánku a syfilis. Mnohé z týchto kampaní ale nepoužívali efektívne sterilizované lekárske nástroje, čo mohlo viesť k šíreniu HIV.