Váš mikrobióm tu žije - MyMicrobiome
Genitourinárny trakt je neuveriteľne vyberavá oblasť tela, pokiaľ ide o jej obyvateľov. Vaginálny mikrobióm je mimoriadne špecializovaný a umožňuje tam žiť iba niekoľkým bakteriálnym druhom. Aj keď je tu mikrobiálna rozmanitosť v porovnaní s inými časťami tela veľmi nízka, jedná sa o veľmi jedinečný ekosystém u ľudí, ktorého úlohou je udržiavať pH v správnom rozmedzí a udržiavať nepriateľov mimo. Baktéria, ktorá tam veľmi rada žije, patrí k druhu Lactobacillus. Väčšina žien má jedno z 5 rôznych mikrobiálnych spoločenstiev, v každej dominuje druh Lactobacillus (L. crispatus, L. iners, L. jensenii alebo L. gasseri). Uvoľňovaním kyseliny mliečnej a chemických zbraní (H2O2 a bakteriozín) zabraňuje Lactobacillus kolonizácii škodlivých organizmov, ako sú kvasinky alebo patogénne baktérie.
Koža je na 1,8 m 2 oveľa zložitejšia, pretože zahŕňa veľmi odlišné krajiny, každá s jedinečným ekosystémom.
Takzvané púštne oblasti pokožky (suchá pokožka, ako je zadok, predlaktie alebo rôzne oblasti ruky) poskytujú najväčšiu mikrobiálnu diverzitu s 19 rôznymi bakteriálnymi deleniami, z ktorých štyri sú dominantné (Actinobacteria (52%), Firmicutes (24%), Proteobacteria (17.)) %) a Bacteroidetes (7%)). Existujú tu dokonca gramnegatívne baktérie, o ktorých sa pôvodne myslelo, že sú kontaminantmi z tráviaceho traktu. Je zaujímavé, že fylogenetická bakteriálna rozmanitosť je na suchej pokožke vyššia ako v ústach alebo v zažívacom trakte tej istej osoby.
Mastné oblasti pokožky (oblasti kožného mazu ako čelo, za uchom, chrbtom a nosnými dierkami) osídľujú hlavne propionibaktérie. Tieto baktérie sú zvyčajne neškodné, iba sa bránia pred nepriateľskými osadníkmi. Príchod puberty však spôsobuje, že hormonálne zmeny menia chemické prostredie na pokožke, najmä na tvári. Tieto zmeny vedú k boju medzi imunitným systémom a propionibaktériami, ktoré sa prejavujú infikovanými mazovými žľazami a teda akné.
Vo vlhkých džungliach kože (vlhké oblasti ako pupok, podpazušie, záhyby zadku, chodidlá, kolená a podpazušie) sa vyskytuje Corynebacterium a stafylokoky. Aj keď je mikrobiálna diverzita vo vlhkých oblastiach nižšia v porovnaní so suchými oblasťami, hustota baktérií je tu najvyššia, pričom viac ako 15 miliónov baktérií je v oblasti veľkej poštovej známky.
Veľmi dôležitým bojovníkom za pokožku je Staphylococcus epidermidis, ktorý aktívne spolupracuje s imunitným systémom pokožky na zabránení prístupu patogénnych baktérií (napr. Staphylocuccus aureus). Rovnako ako všetky ekosystémy v našom tele, aj narušenie tejto symbiózy môže spôsobiť ochorenie. Kožné choroby atopická dermatitída, akné vulgaris a chronické rany sú dobre známymi príkladmi takejto dysbiózy.
Ústa sú pri vchode do gastrointestinálneho traktu. Už tu žije asi 6 miliónov mikroorganizmov, ktoré možno rozdeliť do 4 hlavných divízií (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria a Fusobacteria). To je miesto, kde sa baktérie usadzujú v ústnej sliznici, na zuboch a na jazyku; každá oblasť má svoj vlastný ekosystém s vlastnou výraznou rozmanitosťou. Celkovo v ústach dominuje jeden bakteriálny druh: Streptococcus.
Vďaka vysokému obsahu kyselín je v žalúdku hostená iba bakteriálna populácia s nízkou diverzitou. Skladá sa hlavne z aktinobaktérií a Helicobacter (napr. H. pylori). Okrem regulácie kyslosti v žalúdku reguluje H. pylori uvoľňovanie hormónu ghrelinu, ktorý sa podieľa na regulácii chuti do jedla. Ak táto baktéria chýba, dochádza k zvýšenej produkcii grelínu a tým k väčšej chuti do jedla.
Bohužiaľ, H. pylori si za posledných niekoľko desaťročí zlú povesť spôsoboval žalúdočné vredy u vnímavých jedincov; baktéria bola takmer úplne eliminovaná v našich žalúdkoch antibiotikami, čo vysvetľuje zvýšenú mieru obezity u detí, najmä v Spojených štátoch.
Ak pôjdeme ďalej dole do tenkého čreva a ďalej smerom k hrubému črevu, počet baktérií sa bude dramaticky zvyšovať ďalej. Miliónkrát viac baktérií žije v našich črevách ako na pokožke alebo v ústach. V skutočnosti nie je črevná stena viditeľná, pretože je pokrytá kobercom baktérií.
V črevnom mikrobióme dominujú baktérie z dvoch fylogenetických skupín - Bacteroidetes a Firmicutes. Pomer týchto skupín baktérií navzájom sa veľmi líši od človeka k človeku a hrá veľmi dôležitú úlohu pri obezite. Vyšší podiel Firmicutenu v porovnaní s Bacteroides v čreve súvisí s obezitou.
Okrem schopnosti využívať viac alebo menej energie z potravy má pre nás črevný mikrobióm ďalšie veľmi dôležité funkcie. Na jednej strane sú to metabolické činnosti, ako je syntéza vitamínov, odbúravanie chemických látok a živín a podpora metabolizmu tukov. Na druhej strane je to interakcia s našim imunitným systémom. Náš mikrobióm súťaží so škodlivými baktériami o živiny a priestor na osídlenie a bojuje proti škodlivým útočníkom chemickými zbraňami. Mikrobióm tiež stimuluje náš imunitný systém k dozretiu.