Panel enteropatogénnych baktérií Bioclinic

Užitočnosť gastrointestinálnych panelov molekulárnej biológie

Identifikácia fekálnych baktérií je vzhľadom na biodiverzitu gastrointestinálnej bakteriálnej flóry výzvou. Táto bakteriálna flóra vykazuje výkyvy v reakcii na environmentálne faktory, spotrebu antibiotík, zápalové ochorenia atď.

panel

Gastrointestinálne panely molekulárnej biológie sú alternatívou k tradičným metódam (mikroskopia, kultivácia, testy na antigén atď.), Nedávne štúdie preukázali, že môžu úspešne nahradiť vyššie uvedené metódy. So zvýšenou citlivosťou a špecifickosťou a veľmi rýchlou reakciou ponúka lekárovi možnosť zahájiť cielenú a včasnú terapiu, ktorá skracuje dobu hospitalizácie a implicitne zvyšuje náklady.

Zvýšenie citlivosti metódy je čiastočne spôsobené detekciou bakteriálnej DNA, ktorá môže pretrvávať po liečbe antibiotikami, v rekonvalescencii, u chronických nosičov, čo je kľúčom k správnej retrospektívnej diagnóze.

Panel enteropatogénnych baktérií

Panelové enteropatogénne baktérie sú kvalitatívnym testom molekulárnej biológie uskutočňovaným metódou Real-Time PCR z výkalov u pacientov s podozrením na gastroenteritídu, enteritídu, kolitídu atď.

Panel detekuje> 90% baktérií zodpovedných za hnačkové ochorenia:

  • DNA Salmonella spp.
  • DNA Campylobacter spp. (Jejuni/coli)
  • Shigella spp./E enteroinvazívna coli DNA (EIEC)
  • Gény Shiga toxínu 1 a 2 (stx1, stx2)

Salmonella spp.

Campylobacter spp.

Infekcia Campylobacter je najbežnejšou príčinou otravy jedlom v členských štátoch EÚ. Enterické infekcie Campylobacter sa pohybujú od asymptomatických po ťažké, charakterizované hnačkami s krvou alebo bez krvi, horúčkou a brušnými kŕčmi. Infekcie môžu tiež spôsobiť dlhodobé zdravotné problémy, ako je Guillain-Barrého syndróm a reaktívna artritída.

Shigella/E. enteroinvazívne coli (EIEC)

Existujú štyri podskupiny druhu Shigella: podskupina A (S. dysenteriae), podskupina B (S. flexneri), podskupina C (S. boydii) a podskupina D (S. sonnei). Všetky druhy Shigella sa prenášajú kontaktom s zamorenou osobou alebo požitím kontaminovanej vody alebo potravy (jedinými známymi rezervoármi sú ľudia a iné primáty). Infekcie sa vyskytujú najčastejšie v podmienkach nesprávnej hygieny, napríklad v ústavoch (škôlky, jasle atď.). Shigella je zodpovedná za mnoho stavov, vrátane shigelózy a bakteriálnej úplavice, ktoré môžu spôsobiť hnačky s krvou alebo bez krvi.

Kmene EIEC obsahujú faktory virulencie, ktoré kódujú plazmidy (ako je invazívny plazmidový antigén ipaH), ktoré umožňujú baktérii napadnúť hrubé črevo a spôsobiť syndróm vodnatej hnačky, podobný tomu vyvolanému Shigellou. EIEC je v USA a EÚ zriedkavý a vo svete je menej častý v porovnaní s ETEC a EPEC. Infekcie Shigella a EIEC sa obvykle liečia rovnako.

Producent toxínov E. coli Shiga (STEC)

Existujú dva hlavné typy Shiga toxínov: Shiga toxín 1 (Stx1) a Shiga 2 toxín (Stx2) (tiež známy ako verotoxíny). Producent toxínu E. coli Shiga (STEC) môže obsahovať jeden alebo obidva gény stx. STEC je jednou z hlavných príčin krvácavých hnačiek a môže viesť k uremickému hemolytickému syndrómu (spôsobenému deštrukciou erytrocytov Shiga toxínom, ktorý spôsobuje zlyhanie obličiek), najmä u veľmi malých detí a starších ľudí.

STEC sú dôležité potravinové patogény, infekcia sa môže prenášať cez vodu z jednej osoby na druhú alebo kontaktom so zvieratami (najmä dobytkom, ktorý je rezervoárom STEC).

Antimikrobiálna liečba STEC môže zvýšiť riziko hemolyticko-uremického syndrómu, najmä u kmeňov rezistentných na antibiotiká, zvýšením produkcie, a tým zvýšením množstva Shiga toxínu dostupného na absorpciu. Preto identifikácia génov toxínov Shiga u pacienta s gastrointestinálnym ochorením môže uľahčiť rozhodnutie týkajúce sa predpisovania antibiotík v liečebnej terapii.