Gastrointestinálny panel (baktérie, parazity, vírusy) Bioklinický

Napriek pokroku v oblasti bezpečnosti potravín, hygieny a lekárskeho ošetrenia zostáva infekčná gastroenteritída hlavným problémom v priemyselných krajinách vo všetkých vekových skupinách.

baktérie

Infekčné hnačkové ochorenie je medzinárodne významnou príčinou úmrtnosti malých detí, približne 800 000 úmrtí ročne u detí mladších ako 5 rokov. Hnačkové choroby u detí významne prispievajú k podvýžive, zvyšujú náchylnosť k iným infekciám a môžu byť príčinou porúch rastu alebo intelektuálneho vývoja.

Gastrointestinálny panel je in vitro kvalitatívny multiplexný test PCR, ktorý dokáže súčasne detekovať a identifikovať 22 patogénov (baktérie, množstvo hnačkových patotypov E. coli/Shigella, vírusy a parazity) priamo zo vzoriek stolice v prostredí. Cary Blair, zozbieraný z ľudí so známkami a/alebo príznakmi gastrointestinálnej infekcie.

Baktérie

  • Campylobacter (C. jejuni/C. coli/C. upsaliensis)
  • Clostridium difficile (toxín A/B)
  • Plesiomonas shigelloides
  • Salmonella
  • Vibrio (V. parahaemolyticus/V. Vulnificus/V. Cholerae) vrátane špecifickej identifikácie Vibrio cholerae
  • Yersinia enterocolitica
  • Enteroagregatívna E. coli (EAEC)
  • Enteropatogénne E. coli (EPEC)
  • Enterotoxigén E. coli (ETEC) lt/st
  • Shx produkujúci toxíny E. coli (STEC) stx1/stx2 (vrátane špecifickej identifikácie séroskupiny E. coli O157 zo STEC)
  • Shigella/E. enteroinvazívne coli (EIEC)

vírusy

  • Adenovírus F 40/41
  • Astrovírus
  • Norovírus GI/GII
  • Rotavírus A
  • Sapovírus (Genogroup I, II, IV a V)

škodca

  • Cryptosporidium
  • Cyclospora cayetanensis
  • Entamoeba histolytica
  • Giardia lamblia

Klinické indikácie

Gastrointestinálny panel je indikovaný na diagnostiku patogénov z gastrointestinálnych ochorení; výsledky musia korelovať s klinickými, epidemiologickými a inými lekárskymi laboratórnymi testami.

Pozitívne výsledky nevylučujú súčasnú infekciu mikroorganizmami, ktoré nie sú zahrnuté v skupine. Zistený pôvodca nemusí byť definitívnou príčinou choroby. Negatívne výsledky dosiahnuté v klinických podmienkach kompatibilných s gastroenteritídou môžu byť spôsobené infekciou patogénmi, ktoré neboli zistené týmto testom, alebo neinfekčnými príčinami, ako je ulcerózna kolitída, zápalové ochorenie čriev alebo Crohnova choroba.

Na detekciu a identifikáciu akútnej gastroenteritídy v infekčných ohniskách je tiež užitočný multiplexový test nukleových kyselín na detekciu gastrointestinálnych mikroorganizmov. Vírusová, bakteriálna a parazitická nukleová kyselina môže pretrvávať in vivo bez ohľadu na životaschopnosť mikroorganizmu

Pretože počet asymptomatických nosičov Clostridium difficile je veľmi vysoký, najmä u malých detí a hospitalizovaných pacientov, detekcia toxigénu C. difficile by sa mala interpretovať v kontexte odporúčaní vypracovaných testovacou jednotkou.