Priestorové štruktúry bielkovín - Štátny vzdelávací server Bádensko-Württembersko

Volá sa AA sekvencia proteínu Primárna štruktúra určený. Pri metódach, ktoré sú dnes k dispozícii, stále poskytuje len málo informácií o priestorovom usporiadaní (= priestorovej štruktúre) proteínov.

štruktúry

Pomocou moderných analytických metód (napr. Analýza röntgenovej štruktúry) je možné získať presnejšie informácie o priestorovom usporiadaní.

Predpokladajú sa tri ďalšie úrovne:

Sekundárna štruktúra

Terciárna štruktúra

Kvartérna štruktúra

Najprv späť k peptidovej väzbe:

Doteraz sme peptidové väzby nakreslili ako kostru peptidových alebo proteínových reťazcov ako jednoduché väzby. V skutočnosti toto znázornenie predstavuje iba mezomérnu hraničnú štruktúru peptidovej väzby, ktorá má v dôsledku distribúcie elektrónov medzi väzbou C = O a väzbou NH charakter čiastočnej dvojitej väzby. Z tohto dôvodu je peptidová väzba rozhodujúcim štrukturálnym prvkom.

Mezomérne hraničné štruktúry peptidovej väzby:

Sekundárna štruktúra:

Dlhé polypeptidové reťazce sa môžu priestorovo usporiadať:
Vodíkové väzby medzi C = O a NH skupinami peptidových reťazcov stabilizujú toto priestorové usporiadanie.
Rozlišujú sa medzi 2 formami: α-helix a β-listová štruktúra

α-helix:
Polypeptidový reťazec vo forme skrutky na pravej strane, objavený v α-kreatínoch, fibrilárnych proteínoch vo vlasoch

Štruktúra β-listu:
Peptidový reťazec zložený do kľukatého tvaru, v závislosti od smeru polypeptidových reťazcov, sa hovorí o paralelných alebo antiparalelných listoch.

Terciárna štruktúra:
je ďalšie priestorové usporiadanie proteínov. Opisuje vznik stabilnej priestorovej štruktúry monomérnych proteínov, ktorá pozostáva z kombinácií α-helixov a β-listov, ako aj slučiek a ďalších štruktúrnych prvkov medzi nimi.

Terciárna štruktúra je tvorená interakciami medzi postrannými reťazcami aminokyselín:

  • Vodíkové mosty
  • hydrofóbne interakcie
  • Iónové väzby
  • Disulfidové mosty

Kvartérna štruktúra:

Niekoľko identických proteínových reťazcov s vlastnou primárnou, sekundárnou alebo terciárnou štruktúrou sa spája a vytvára funkčnú jednotku.
Mnoho proteínov v ľudskom organizme je dimér (2 funkčné jednotky) alebo tetramér, ale ich počet môže byť tiež podstatne väčší.