ÚSTAV GENETIKY, FYZIOLÓGIE A OCHRANY RASTLÍN Rukopisom C

ÚSTAV GENETIKY, FYZIOLÓGIE A OCHRANY RASTLÍN Ako rukopis C.Z.U. 633,854,78: 631,523 (043,2) NECHIFOR VICTORIA AKCIA GIBERELINE NA MIKROSPOROGÉNU SLNEČNÍKOV (HELIANTHUS ANNUUS L.) 162.01. RASTLINNÁ GENETIKA Doktorandská práca z biologických vied Vedúca vedúca DUCA Maria, habilitovaná lekárka z biologických vied, univerzitná profesorka, akademička Autor NECHIFOR Victoria CHIŞINĂU, 2018

genetiky

4.2.1. Bioinformatika charakteristická pre gény CycD3, PCNA1, HIS1-3, H1.3. 73 4.2.2. Analýza výsledkov expresie. 79 4.3. Štúdium génovej expresie zapojenej do segregácie chromozómov MND1, AHP2, ASK1, DYAD. 83 4.3.1. Bioinformatika charakteristická pre gény. 83 4.3.2. Analýza výsledkov expresie. 89 4.4. Vyhodnotenie úrovne expresie génov s funkciami pri tvorbe a aktivite bunkových membrán. 93 4.4.1. Bioinformatika charakteristická pre gény EXPA1, GSL12. 94 4.4.2. Analýza výsledkov expresie. 96 4.5. Závery v kapitole 4. 101 VŠEOBECNÉ ZÁVERY A ODPORÚČANIA. 103 BIBLIOGRAFIA. 105 PRÍLOH. 127 Príloha 1. Zákon, ktorým sa vykonávajú vedecké výsledky v odbornej príprave. 127 Príloha 2. Zákon, ktorým sa vykonávajú vedecké výsledky pri zlepšovaní. 128 VYHLÁSENIE O ZODPOVEDNOSTI. 129 ŽIVOT AUTORA. 130 4

ZOZNAM SKRATIEK ABA kyselina abscisová AG3 kyselina giberelová AIA - kyselina indolyloctová AJ kyselina jasmónová AS kyselina salicylová ASC cytoplazmatická androsterilita ASI indukovaná androsterilita BLAST Základné lokálne zarovnanie Vyhľadávací nástroj BR brassinosteroid CDK cyklín dependentné kinázy CMP Secene PCylquate D ester pollinate označený) ET etylén FC zmena zloženia IGFPP Ústav genetiky, fyziológie a ochrany rastlín MO optická mikroskopia NCBI Národné centrum pre biotechnologické informácie NT - Pb nukleotidy bázové páry PCNA - proliferujúci jadrový bunkový antigén PCR polymerázová reťazová reakcia RE endoplazmatické retikulum SM mužská sterilita TAE Tris-acetát-EDTA TBE Tris-borát-EDTA UV ultrafialové svetlo 8

haploidné jadrá tvoriace tetrády s mikrospórami. (Obrázok 3.6, d). Plazmalema každej bunkovej steny je čoraz podlhovastejšia, takže sa rozprestiera vo vnútri ložiska stonky a zostáva periférna. Na konci tetradovej fázy sú tieto nepravidelne tvarované bunky vyzerajúce plazmódium s intenzívne polyploidizovanými jadrami navzájom oddelené na svojich radiálnych povrchoch, zatiaľ čo stredná vrstva je tenká a zdegenerovaná. Po digescii steny kalicha sa pozorovali dobre tvarované, intenzívne sfarbené mikrospóry v mikrosporangiu prašníkov z plodných kvetov väčších ako 3,5 mm (obrázok 3.6, e). Obr. 3.6. Peľové kmeňové bunky v rôznych štádiách mikrosporogenézy. Poznámka: I plodné rastliny, II rastliny s ASI; a, f leptotén; b, g pachiten; c, h divízie; d, i tetrade; e, j mikrospóry x 1600 (c, f); x640 (a, b, d, e, g, h, i, j) postmeiotický vývoj mikrospór: ich individualizácia a uvoľňovanie z tetrády, depozícia primárneho exinu, tvorba ekvinulácií sa vyvíjajú podľa druhu, zvýrazňujúc postupný, synchronizovaný rozpad tkaniva tapeta. Obr. 3. 7. Pásikové bunky v rôznych fázach mikrosporogenézy Poznámka: I plodné rastliny; II rastliny s ASI; a a profáza I; b, f divízie; c, g tetrade; d, h štádium mikrospór. Mierka 15 = um. 57

Vyhľadávanie kľúčových slov zvýraznilo lokus: ACO58770.1, ktorý kóduje 68 aminokyselinovú proteínovú sekvenciu definovanú ako proteín podobný A4, čiastočne [Helianthus annuus]. BLASTX transkriptovej sekvencie študovanej s proteínom podobným expansínu A4 [Helianthus annuus] naznačuje veľmi nízky stupeň podobnosti (skóre: 72,4/72,4, pokrytie: 25%, hodnota E: 7e-22, identita: 66%) (obrázok) 4,20, B). A B Obr. 4.20. Sekvenčná analýza CCFT9238.b1_K05.ab1. prostredníctvom programov BLASTN (A) a TBLASTX (B). Databáza HELIAGENE [295] predstavuje hypotetické transkripty slnečnice funkčne pripisované expansínom s rôznymi stupňami expresie v rôznych orgánoch, ale ich génová sekvencia nevykazuje podobnosť s prepisom študovaným v tomto článku. 4.4.2. Analýza výsledkov expresie Analýza expresie génu GSL12 v slnečnici, ktorá sa zúčastňuje biosyntézy kalusu, ukázala štatisticky významný nárast (p