TESTOVANÉ súpravy na testovanie mikrobiómu - MyMicrobiome
Aspoň od „Gut mit Charme“ vieme, že črevo je stredobodom nášho zdravia a pohody. Dlho zanedbávaný výskum sa zameral na črevo a jeho spolubývajúcich, náš mikrobióm, už dobrých 10 rokov. Spolu s tým vedci z celého sveta katalogizujú mikrobióm našej pokožky, úst, pľúc, urogenitálneho traktu a predovšetkým našich čriev. Týmto spôsobom sa snažia zistiť, ktoré mikrobiálne zloženie v jednotlivých oblastiach tela predstavuje zdravý a vyvážený mikrobióm, alebo sa naučiť, ako túto rovnováhu najlepšie obnoviť, keď sú narušené mikrobiálne ekosystémy na nás a v nás.
Testovacie súpravy na mikrobióm vyrastali ako huby po celom svete
Súbežne s vedeckým úsilím sa na celom svete ako huby po daždi objavujú súpravy na testovanie mikrobiómu dostupné pre širokú verejnosť. Čo robia tieto testy? Čo za testy existujú a v čom sú odlišné? Spoločnosť MyMicrobiome sa zamerala na testy mikrobiómu dostupné na trhu.
O autotest sme požiadali viac ako desať poskytovateľov vrátane spoločností uBiome, Viome, Biohm, Ihcode a DayTwo. Celkom päť súhlasilo s účasťou a dali sme ich pod mikroskop:
- Biomes.world(Nemecko)
- Thryve(SPOJENÉ ŠTÁTY)
- Atlas Biomed(Veľká Británia)
- TFTAK(Estónsko)
- Medivere(Nemecko)
Každú súpravu sme testovali dvakrát, pred a po konzumácii probiotického jogurtu denne počas dvoch týždňov.
Vyhodnotenie testovaných súprav na testovanie mikrobiómov podľa rôznych kritérií
Dodanie/balenie/pokyny/vrátenie
Celkovo boli všetky súpravy dodané rýchlo (do týždňa). Iba produkt z USA uviazol v colnici. Všetky súpravy boli pekne zabalené v krabici, okrem súpravy od TFTAK je balenie stále vo vývoji. Obsahovo boli súpravy od Biomes, Thryve a TFTAK veľmi podobné. K dispozícii bol tampón, malá skúmavka so stabilizačnou kvapalinou pre vzorku a pokyny na odobratie vzorky. Atlasová vzorkovacia trubica bola o niečo väčšia a bolo potrebných viac vzorky. Medivere nemal v trubici stabilizačnú tekutinu a bolo potrebných asi 25 ml vzorky, takže tu bolo menej bodov. Spoločnosti TFTAK, Medivere a Atlas tiež poslali lapače stolice, TFTAK a Thryve mali náhradnú súpravu pre prípad, že by sa niečo pokazilo.
Najjednoduchší spôsob vrátenia vzoriek bol pomocou spoločností Atlas, Biomes a Medivere, pretože tieto mali na palube vratnú obálku alebo obal zaplatený poštovným. K dispozícii bola vratná schránka na vrátenie súpravy Thryve Kit, náklady na poštovné si však musíte najskôr hradiť sami. Po odoslaní dokladu vám bude suma vrátená prostredníctvom služby PayPal. Pretože TFTAK ešte nemá žiadny obal, neexistovala žiadna spätná obálka ani poštovné, ale to sa určite zmení, akonáhle bude krabica na balení hotová.
Na výsledky sme si museli počkať 2 týždne až viac ako 3 mesiace, výsledky z TFTAKu sa dostavili najnovšie.
Výsledky boli prezentované na takzvanom prístrojovom paneli (Thryve, Biomes, Atlas) alebo zhrnuté v správe (Biomes, Medivere, TFTAK). Prihlásite sa na palubnú dosku a máte iba prehľad, z ktorého máte prístup do rôznych oblastí. Táto palubná doska bola navrhnutá viac-menej jasne. Biomes a Thryve uľahčovali prehľadávanie, s Atlasom som mal často problémy nájsť požadované údaje, niektoré veci boli veľmi skryté.
Panely poskytovateľa
Celkovo nájdete na informačných paneloch viac informácií ako v prehľade, iba musíte veľa vyhľadávať a prehliadať. Ďalšou výhodou informačných panelov je, že si môžete svoje baktérie podrobne prezrieť. Jedným kliknutím sú vysvetlené ďalšie informácie o príslušnej baktérii.
Správy od spoločností Biomes, Medivere a TFTAK boli vypracované veľmi dobre a poskytujú veľmi dobrý prehľad o všetkom. Spoločnosť Medivere rozdelila analyzované baktérie do funkčných skupín a poskytla zoznam nájdených bakteriálnych domén.
Biomes sumarizuje údaje z prístrojovej dosky na novom prístrojovom paneli (od polovice novembra 2018) a poskytuje recepty šité na mieru skúmanému mikrobiomu.
TFTAK uviedol najbežnejšie baktérie v skúmanej vzorke s ich vlastnosťami, v dodatočnej tabuľke boli porovnané najbežnejšie baktérie v zdravej porovnávacej populácii (tu z Estónska) s ich výskytom v skúmanej vzorke.
Výsledky rôznych analýz boli veľmi rôznorodé.
Všetky analýzy poskytovali informácie o rozmanitosti mikrobiómu, tipy na zdravie a tipy na výživu. Biomes a Medivere potvrdili veľmi vysokú rozmanitosť testovaného mikrobiómu, zatiaľ čo rozmanitosť v ďalších troch testoch dopadla horšie. Za dva týždne jogurtovej diéty sa však rozmanitosť zvýšila. Čím vyššia je odroda, tým lepšie pre vaše zdravie.
Infobox: Enterotypy
Podľa toho, ktoré bakteriálne skupiny dominujú vo vašom mikrobióme, je možné rozdelenie do jedného z 3 enterotypov, ktoré súvisia s vašou stravou:
V tomto mikrobióme dominujú Bacteroides, kde tvoria v priemere až 80% bakteriálneho ekosystému. To znamená, že touto dominanciou trpí rozmanitosť mikrobiómu. Tieto baktérie sú kŕmené jednoduchými cukrami, živočíšnymi tukmi a bielkovinami.
Tento typ mikrobiómu dominuje Prevotella, ktoré sú zvyčajne izolované od domorodých kmeňov Amazonky a Afriky. Vaša strava pozostáva väčšinou z rastlinných vlákien a len veľmi malého alebo žiadneho jednoduchého cukru, mäsa alebo tukov. V Európe je tento enterotyp pozorovaný hlavne u vegetariánov.
Skupinu baktérií, ktorá dominuje v tomto enterotype, vedie Ruminococcus, za ktorým nasleduje Eubacterium, Dorea a ďalšie. Táto skupina baktérií je obzvlášť dobrá pri produkcii kyseliny maslovej, mastnej kyseliny s krátkym reťazcom s protizápalovými vlastnosťami. Táto skupina používa hlavne sacharidy, ako je rezistentný škrob a celulóza (zo šošovice, fazule alebo celých zŕn).
Nie každý produkt obsahoval informácie o enterotype
Zatiaľ čo Thryve a TFTAK neposkytli žiadne informácie o enterotype, výsledky od spoločnosti Biomes boli zhodné s výsledkami od spoločnosti Atlas. Medivere píše, že v obidvoch testoch sme mali enterotyp 3, zatiaľ čo výsledky ukazujú enterotyp 1, teda dominanciu Bacteroides.
Ďalším zaujímavým výsledkom je pomer bakteriálnych domén Firmicutes k Bacteroidetes. Firmicutes sú obzvlášť dobré pri využívaní tukov, takže vysoký pomer Firmicutes/Bacteroidetes má tendenciu rýchlejšie priberať. Ideálny pomer by mal byť medzi 1 a 3. Podľa spoločnosti Biomes má náš testovaný mikrobióm veľmi vysokú spotrebu kalórií, zatiaľ čo v ostatných testoch sme optimálnejší. Atlas a TFTAK neposkytli žiadne informácie o pomere Firmicutes/Bacteroidetes.
Výsledky rôznych testov boli celkovo veľmi odlišné.
Všetky testy sa uskutočňovali s rovnakou vzorkou, ale už boli zrejmé rozdiely v požadovanom množstve vzorky a v type konzervácie vzorky. Pre Biomes, Thryve a TFTAK stačil tampón z toaletného papiera, zatiaľ čo Atlas vyžaduje približne 2 ml a Medivere dokonca 25 ml vzorky. Všetky testy, s výnimkou Medivere, obsahovali v skúmavke stabilizačný roztok. Je to nevyhnutné, aby sa na jednej strane baktérie nemnožili cestou do laboratória a aby sa na druhej strane stabilizovala bakteriálna DNA a RNA, ktorá sa vyšetruje v laboratóriu. Typ stabilizačného roztoku môže ovplyvniť výsledky.
Vo všetkých prípadoch bol mikrobióm analyzovaný pomocou 16s rRNA analýzy, bežnej metódy, ktorá len čiastočne klesá na úroveň bakteriálnych druhov. Pretože každá baktéria má iný počet kópií 16s rRNA, musí sa na určenie skutočného počtu baktérií vo vzorke použiť správny algoritmus. Aj tu človek dospeje k iným výsledkom. Nakoniec záleží aj na tom, s akou databázou sa výsledky porovnávajú. Každý výrobca má v súčasnosti svoju vlastnú databázu, ktorá je viac alebo menej rozsiahla, väčšinou regionálna. Získané výsledky sa vždy porovnávajú s komunitou a v závislosti od situácie sa hodnoty v porovnaní zvyšujú alebo znižujú. Preto je vhodné zvoliť výrobcu, ktorý sa nachádza v tej istej krajine alebo aspoň na tom istom kontinente. Priemerný mikrobióm európskej populácie sa líši napr. B. veľmi odlišné od severoamerických alebo ázijských.
Napriek rozdielom vo výsledkoch väčšina analýz preukázala podobné trendy v zložení mikrobiómu.
V prvom teste zodpovedala testovaná osoba enterotypu 2 a v druhom teste enterotypu 3 (Biomes, TFTAK a Atlas). Tieto dva enterotypy veľmi dobre ladia s stravou testovanej osoby.
V 3 z 5 testov (Biomes, TFTAK a Medivere) sa zvýšil podiel prozápalových baktérií (proteobaktérií).
Bakteriálna diverzita sa zlepšila alebo zostala rovnako dobrá vo všetkých testoch od prvého do druhého testu.
Odporúčania týkajúce sa stravovania sú skôr všeobecné
- Biomes a Thryve ponúkajú tú pravú zmes probiotík. Odporúča sa špeciálna strava v závislosti od nedostatku bakteriálnych skupín alebo druhov. Biomes v súčasnosti reviduje svoj hlavný panel a na novom paneli (online od polovice novembra) má k dispozícii podrobnú správu PDF o výsledkoch vrátane odporúčaní receptov špeciálne pre váš mikrobióm. Môžete tiež zistiť, ktoré živiny môže vyšetrovaný mikrobióm obzvlášť dobre využiť a pre ktoré živiny baktérie chýbajú. Okrem toho poskytujú informácie o možnej potravinovej intolerancii v dôsledku zloženia mikrobiómu.
- Atlas vydáva týždenné odporúčania týkajúce sa jedla prostredníctvom e-mailu.
- Čo sa mi páčilo: Pomocou Thryve môžem kliknúť na baktériu a zistiť, ktoré potraviny môžem použiť na podporu rastu tejto baktérie v mojich črevách.
Všetky analýzy poskytujú indikácie možných chorôb
Pri všetkých analýzach dostávam indikáciu možných chorôb, ktoré sa môžu vyskytnúť konkrétne v dôsledku nerovnováhy v analyzovanom mikrobióme.
Pokračovať
Veda o ľudskom mikrobióme je stále veľmi skoro. Napriek tomu už existuje veľa jasných dôkazov o tom, ako môže náš mikrobióm ovplyvňovať naše zdravie. Výsledky rôznych testov sa líšia v závislosti od rôznych použitých techník a databáz, ale je možné rozpoznať tendencie, ktoré prechádzajú všetkými testami. Je ťažké povedať, ktorý z testov má najlepšiu analytickú metódu. Pre ľudí, ktorí majú pocit, že niečo nie je v poriadku s ich črevným zdravím, alebo pre tých, ktorí chcú len vedieť, ako môžu urobiť niečo dobré pre svoje zdravie, je určite užitočný takýto test na mikrobiómy.
Záver je však, a to sa tiež ukázalo v každom teste, že strava s nízkym obsahom bielkovín a tukov a bohatá na rastliny zvyšuje biodiverzitu nášho mikrobiómu. To však neznamená, že by ste sa mali úplne vyhýbať bielkovinám a tukom, ale ako všetci vieme, jedlo by malo byť čo najviac neupravené, čerstvé a farebné. Čím rozmanitejšia je strava, tým väčšia je rozmanitosť nášho mikrobiómu.
Som si istý, že testy sa stanú lepšími a spoľahlivejšími s ďalším vývojom technických možností a ďalším výskumom mikrobiómu. Na získanie zhodných výsledkov sú však nevyhnutne potrebné všeobecne platné štandardy pre mikrobiómové analýzy a odber vzoriek.!
Preto budeme tiež vykonávať testy v pravidelných intervaloch a budeme vás informovať.