Mentálne postihnutie; 36246; Ukážka pred tlačou

Skríning duplikácie/vymazania syndrómu Aicardi-Goutières

36246

RNASEH2A M., RNASEH2B M., RNASEH2C M., TREX1 M., SAMHD1 M.

Aicardi-Goutièresov syndróm

ADAR, IFIH1, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, SAMHD1, TREX1 (7 génov)

ADNP, ANK2, ANKRD11, ARID1B, ASH1L, ASXL3, BAZ2B, BCKDK, BCL11A, CACNA1D, CACNA1H, CACNA2D3, CEP41, CHD2, CHD8, CIC, CNOT3, CNTN4, CNTNAP2, CTDC1, CADC DSCAM, DYRK1A, EIF4E, ERBB2IP, FOXP1, GABRB3, GIGYF2, GRIA1, GRIN2B, GRIP1, ILF2, INTS6, IRF2BPL, KAT2B, KATNAL2, KDM5B, KDM6A, KMT2A, MBELC2, KMT2A, MBELC2, K MED13, MED13L, MET, MYT1L, NAA15, NCKAP1, NCOR1, NLGN3, NLGN4X, NRXN1, PHF3, POGZ, PTCHD1, PTEN, RANBP17, RELN, RIMS1, RPL10, SCN2A, SCN9A, SET, SETD5, SHANK, SH2 SLC9A9, SMARCC2, SPAST, SRCAP, SRSF11, SYNGAP1, TAOK2, TBL1XR1, TBR1, TCF20, TMLHE, TNRC6B, TRIO, TRIP12, UBN2, UPF3B, USP15, USP7, WAC, WDFY3 (95 génov)

Porucha autistického spektra (ASD) je neurovývojová porucha charakterizovaná deficitmi v sociálnej komunikácii, nedostatkom alebo oneskorením vývinu jazyka a stereotypným alebo opakujúcim sa správaním. Autizmus má veľa príčin, ako to dokumentujú stovky neurologických syndrómov s rôznymi príčinami, výsledkami a reakciami na liečbu. Genetickú príčinu možno v súčasnosti identifikovať u 20 až 25% detí s autizmom. U jedincov sa môžu vyskytnúť poruchy jedného génu, pri ktorých sú neurologické nálezy spojené s poruchou autistického spektra (ASD)

Možno identifikovať 5% pacientov s ASD. Na autizmus sa dá pozerať ako na zložitý (t. J. Prítomnosť dysmorfných znakov a/alebo mikrocefálie) alebo zásadný (t. J. Absencia fyzických abnormalít a mikrocefálie). Asi 20% nesie novo vyvinuté CNV, a preto ako prvá etapa diagnostiky odporúčame pole SNP pre celý genóm.

ADCK3, ANO10, APTX, COQ2, COQ4, COQ5, COQ6, COQ7, COQ8A, COQ8B, COQ9, ETFA, ETFB, ETFDH, PDSS1, PDSS2, SLC25A26 (17 génov)

ARID1A, ARID1B, ARID2, DPF2, SMARCA4, SMARCB1, SMARCC2, SMARCE1, SOX11, SOX4 (10 génov)

The Coffin-Sirisov syndróm je stav, ktorý ovplyvňuje niekoľko systémov tela. Väčšina ľudí má mierne až ťažké intelektuálne postihnutie alebo oneskorený vývoj reči a motorických schopností, ako je sedenie a chôdza. Ďalšou charakteristikou syndrómu Coffin-Siris je nedostatočný rozvoj (hypoplázia) končekov prstov alebo prstov na nohách, hypoplázia alebo nedostatok nechtov. Tieto abnormality sú najčastejšie na piatych prstoch alebo prstoch na nohách. Väčšina ľudí má navyše rysy tváre, ktoré sú popisované ako hrubé. Patria sem zvyčajne široký nos s plochým mostom nosa, široké ústa so silnými perami a silné obočie a mihalnice. Coffin-Sirisov syndróm je spôsobený mutáciami v ARID1A-, ARID1B-, SMARCA4-, SMARCB1- alebo SMARCE1-Príčiny génov. Každý z týchto génov kóduje podjednotky niekoľkých rôznych proteínových komplexov SWI/SNF. Komplexy SWI/SNF regulujú génovú aktivitu (expresiu) prostredníctvom procesu známeho ako remodelácia chromatínu.

Syndróm Cornelia de Lange

ANKRD11, AFF4, BRD4, HDAC8, NIPBL, RAD21, SMC1A, SMC3, UBE2A (9 génov)

Fragile X-Synrom Repeat Analysis

Poruchy glykozylácie

ALG11, ALG1, ALG12, ALG3, ALG6, ALG8, CCDC115, COG5, DOLK, DPAGT1, DPM1, MGAT2, MPDU1, MPI, NGLY1, PGM1, PMM2, SLC35C1, SRD5A3 (19 génov)

ALG1, ALG11, ALG12, ALG13, ALG2, ALG3, ALG6, ALG8, ALG9, ATP6V0A2, B3GLCT, B4GALT1, CAD, CCDC115, COG1, COG2, COG4, COG5, COG6, COG7, COG8, DDT1, D DPM1, DPM2, DPM3, FUT8, GMPPA, GNE, MAGT1, MAN1B1, MGAT2, MOGS, MPDU1, MPI, NGLY1, NUS1, PGM1, PMM2, RFT1, SEC23B, SLC35A1, SLC35A2, SLC35C1, SRD439A3, STT3B, TMEM165, TUSC3, TMEM199 (54 génov)

The Syndróm delécie chromozómu 1q41-q42 by mali byť vopred cytogeneticky vylúčené.

Skríning duplikácie/delécie Holoprosenzepahlie

SHH M., ZIC2 M., SIX3 M., GLI2 M., TGIF1 M.

CDON, CNOT1, FGF8, FGFR1, FOXH1, GLI2, GLI3, NODAL, PTCH1, SHH, SIX3, TDGF1, TGIF1, ZIC2 (14 génov)

AHI1, CC2D2A, CEP290, C5ORF42, TMEM67 (5 génov)

AHI1, ARL13B, ARMC9, B9D1, B9D2, C2CD3, C21ORF2, C5ORF42, CC2D2A, CEP104, CEP120, CEP164, CEP290, CEP41, CSPP1, INPP5E, KIAA0556, KIAA0560, KIAA0586, KIAA0586, KIAA0586, KIAA0586, KIAA0586 PIBF1, RPGRIP1L, SUFU, TCTN1, TCTN2, TCTN3, TMEM107, TMEM138, TMEM216, TMEM231, TMEM237, TMEM67, TTC21B, ZNF423 (39 génov)

Ten klasický Joubertov syndróm (JS) sa vyznačuje tromi primárnymi nálezmi: výraznou malformáciou malého mozgu a mozgového kmeňa, známou ako znak molárneho zuba (MTS), a hypotenziou a oneskorením vývoja. MTS vyzerá pri zobrazovaní magnetickou rezonanciou (MRI) ako molár a je výsledkom hypoplázie cerebelárneho červa a ďalších malformácií mozgu (stredný a zadný mozog). Medzi ďalšie znaky spojené s Joubertovým syndrómom patria abnormality sietnice, nystagmus, ataxia, polydaktylia, fibróza pečene a ochorenie obličiek. Pretože JS je založená na chybnej ciliárnej biológii, je klasifikovaná ako ciliopatia. Odhady prevalencie sú medzi 1: 80 000 a 1: 100 000, možno s vysokým počtom neohlásených prípadov.

CHD7, EYA1, FLNB, IRF6, KDM6A, KMT2D, SIX5 (7 génov)

Zo 7 028 chorôb s podozrením na mendelovské dedičstvo je 1 139 recesívnych a so zavedeným molekulárnym základom. S Mendelovými chorobami sa stretávame zriedka, ale sú celkovo

20% detskej úmrtnosti a

Infantilná leukodystrofia

ABCD1, AIMP1, ARSA, ASPA, DARS2, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, GALC, GFAP, GJC2, HEPACAM, MLC1, PLP1, PSAP, RNASET2, TUBB4A (19 génov)

Leukodystrofie/encefalopatie dospelých

ABCD1, ARSA, CSF1R, CYP27A1, DARS2, EIF2B5, GALC, GFAP, HTRA1, LMNB1, MLC1, NOTCH3 (12 génov)

Leukodystrofie sú dedičné poruchy myelínu, ktoré ovplyvňujú bielu hmotu centrálneho nervového systému s alebo bez myelínového postihnutia periférneho nervového systému. Leukodystrofie s identifikovanou genetickou príčinou sa môžu dediť ako autozomálne dominantné, autozomálne recesívne alebo X-viazané recesívne znaky. Genetická leukoencefalopatia je dedičná a spôsobuje abnormality bielej hmoty, ale nevyhnutne nespĺňa prísne kritériá leukodystrofie (PubMed: 25649058). Hlavným diagnostickým nástrojom pre leukodystrofiu a leukoencefalopatiu je zobrazovanie. Presná diagnóza je však zložitá, pretože fenotypy sú rôzne a v tej istej skupine môžu existovať rôzne klinické prejavy. Genetické testy vedú k rozšíreniu fenotypového spektra leukodystrofií/encefalopatií.

Glycínové encefalopatie

AMT, BOLA3, GCSH, GLDC, GLRX5, LIAS, LIPT1, NFU1, SLC6A9 (9 génov)

20% choroby) a GCSH (kódovanie zložky H-proteínu v komplexe GCS s podielom ⌂

The Syndróm Miller-Dieker Lissencephaly je cez Duplikácie na chromozóme 17p13.3 pri podozrení sa odporúča cytogenetické vyšetrenie.

Screening duplikácie/delécie lissencefalie (externé laboratórium)

ARX, DCX, KATNB1, LAMB1, NDE1, PAFAH1B1, RELN, TMTC3, TUBA1A, TUBB2B, VLDLR (11 génov)

Periventrikulárna heterotopia

ARF1, ARFGEF2, DCHS1, FLNA, NEDD4L (5 génov)

Periventrikulárna heterotopia je stav, pri ktorom nervové bunky (neuróny) nemigrujú správne počas skorého vývoja mozgu plodu od približne 6 týždňov do 24 týždňov tehotenstva. Heterotopia znamená „nemiestne“. Pri normálnom vývoji mozgu sa neuróny tvoria v periventrikulárnej oblasti, ktorá sa nachádza okolo dutín (komôr) naplnených tekutinou blízko centra mozgu. Neuróny potom migrujú smerom von a tvoria zovňajšok mozgu (mozgovú kôru) v šiestich vrstvách podobných cibuli. Pri periventrikulárnej heterotopii niektoré neuróny nemigrujú do svojej správnej polohy a vytvárajú zhluky okolo komôr. Vo väčšine prípadov je periventrikulárna heterotopia spôsobená mutáciami v géne FLNA. Tento gén obsahuje pokyny na výrobu proteínového filamínu A, ktorý pomáha budovať sieť proteínových vlákien (cytoskeleton), ktoré poskytujú bunkám štruktúru a umožňujú im meniť tvar a pohyb. Určité mutácie v FLNA-Gen vedie k narušeniu proteínu FLNA, ktorý nemôže vykonávať túto funkciu, a tým narúša normálne migračné vzorce neurónov počas vývoja mozgu.

ADGRG1, AKT3, FH, GPSM2, KIFBP, LAMC3, NDE1, NSDHL, OCLN, RAB18, SRPX2, TUBA1A, TUBA8, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, WDR62 (17 génov)

ACTB, ACTG1, ADGRG1, AKT3, APAF1, ARF1, ARFGEF2, ARX, ATP6V0A2, B3GALNT2, B4GAT1, CCND2, CDK5, COL4A1, COL4A2, CRADD, CSNK2A1, CTNNA2, DC, EMCH2, D1, EMCH2, D ERMARD, FAT4, FH, FKRP, FKTN, FLNA, GMPPB, GRIN1, GRIN2B, ISPD, KATNB1, KIF1B, KIF2A, KIF5C, LAMB1, LAMC3, LARGE1, MACF1, MEF2C, MTCL, NDE1, NEDB4LFA PIK3CA, PIK3R2, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, PRUNE1, RAB18, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RAC3, RELN, RTTN, RXYLT1, SHH, SIX3, TUBC1DUB, TUBUB, TUBUB1, TUBUB TUBG1, VLDLR, WDR62, WDR81, YWHAE (80 génov)