Reflux spôsobuje oslabený sval zvierača
V mnohých prípadoch je príčinou refluxu oslabený alebo už nefunkčný sval pažerákového zvierača. Normálne má za úlohu utesniť žalúdok proti pažeráku a zabrániť spätnému toku obsahu žalúdka do pažeráka.

Sval sa krátkodobo uvoľní iba pri jedle, aby sa prehltnuté jedlo dostalo do žalúdka. Hneď potom sa sval opäť napne a pevne utesní žalúdok.
Reflux: Keď je zvierač narušený
U ľudí trpiacich refluxnou chorobou je narušená funkcia zvierača. Pre niektorých trpiacich zvierač sa uvoľní bez zjavnej príčiny bez ohľadu na prehltnutie jedla je zvierač všeobecne príliš slabý. Aj keď je napätý, nevytvára dostatočný tlak na to, aby ponúkol dostatočnú odolnosť voči obsahu žalúdka. Vďaka tomu môže voľne prúdiť do pažeráka a dôjde k refluxu. The V mnohých prípadoch nie je známa príčina dysfunkcie zvierača. Existujú však niektoré rizikové faktory, ktoré umožňujú vznik refluxnej choroby.
Refluxná choroba má rôzne príčiny
- Zvýšený tlak v žalúdku, napríklad u ľudí, ktorí majú veľkú nadváhu alebo po jedle veľkých jedál - najmä tesne pred spaním
- mastné alebo korenené jedlá
- Dym
- silná konzumácia alkoholu a kávy
- stres
- tehotenstvo
- Operácie na žalúdku a na pažerákovom zvierači
- Zúženie žalúdočného vývodu a zhoršené vyprázdňovanie žalúdka
- abnormálne tvrdnutie tkaniva (skleróza)
- niektoré lieky (napríklad blokátory kalciových kanálov, anticholinergiká, antikoncepčné pilulky)
Aj u zdravých ľudí s neporušeným zvieračom pažeráka sa žalúdočná kyselina občas dostane do pažeráka. Pažerák má však schopnosť sám sa očistiť a zbaviť sa škodlivej žalúdočnej kyseliny. Pri vyšetrovaní niektorých ľudí s refluxnou chorobou lekári zistili, že tento samočistiaci mechanizmus je narušený. To zvyšuje čas, počas ktorého je výstelka pažeráka vystavená škodlivej kyseline.