Štruktúra 5 uzáverov

The Štruktúra čiapky je modifikácia 5'-konca, ktorý sa nachádza vo všetkých eukaryotických mRNA a mnohých nekódujúcich RNA. Toto je zvyčajne modifikovaný guanínový nukleotid, ktorý je pripojený k hlavnému koncu RNA prostredníctvom vzácnej 5'-5'-fosfodi-esterovej väzby počas transkripcie génu (hovorí sa o Capping).

štruktúra

Ďalšie odporúčané odborné znalosti

Trvale presné testovacie závažia vďaka 12 tipom zadarmo

Vyšší výkon váženia v 6 jednoduchých krokoch

Ako rýchlo skontrolovať pipety?

Títo Vrchnáky-Štruktúra dramaticky zvyšuje stabilitu RNA a je dôležitá pre transport RNA z jadra do cytoplazmy a následnú transláciu mRNA ribozómami. Rovnako ako zostrih a polyadenylácia (chvostovanie), aj capping prebieha kotranskripčne, t.j. zatiaľ čo RNA polymeráza stále syntetizuje RNA. Jeden preto hovorí o továrni na RNA (pozri zostrih).

Aké sú čiapočkové štruktúry?

U mediálnych RNA, ktoré sú transkribované RNA polymerázou II, sa nachádza klasická m 7 G viečko Tu (po hydrolýze terminálneho gama fosfátu trifosfatázou) takzvaný cappingový enzým prenáša zvyšok GMP (z GTP) vo forme väzby 5'-5'-fosfodiesteru na 5 'koniec RNA a potom na Pozícia 7 guanínu s konzumáciou metylovaného S-adenosylmetionínu (SAM/Adomet, donor univerzálnej metylovej skupiny), výsledok: 5'-5 ' m 7 GpppN. Ďalej sa vyskytujú ďalšie metylácie prvých báz mRNA, jedna potom hovorí o Cap1, Cap2 atď.

Niektoré vírusy vykazujú zvláštnosť v biosyntetickej dráhe štruktúry viečka: GTP je najskôr metylovaný a až potom prenesený do RNA.

V niektorých snRNA, ktoré pri spájaní vykonávajú dôležité funkcie, sa m3 G-čiapka, úprava m 7 G-viečko, v ktorom boli ďalšie dve metylové skupiny prenesené do polohy 2 bázy počas dozrievania v cytoplazme ( m2,2,7 trimetylguanozín).

Transkripty RNA polymerázy III neobsahujú také štruktúry s 5 čiapkami, ale niekoľko RNA má monometyláciu na zvyšku y-fosfátu (napr. U6 snRNA).

Ďalej napríklad v trypanozómoch možno nájsť oveľa komplikovanejšie štruktúry viečok, v ktorých je modifikovaný nielen prvý nukleotid, ale aj nasledujúce (napr. Trypanosoma brucei Cap-4).

funkcia

Rovnako ako koniec poly A na 3 ‘konci mRNA, štruktúra viečka hrá dôležitú úlohu pri stabilizácii mRNA. Bez tejto štruktúry sa mRNA v cytoplazme rýchlo rozkladajú z 5 ’na 3’ exonukleázami.

Uzáver tiež hrá dôležitú úlohu pri vypúšťaní RNA z bunkového jadra cez jadrové póry do cytoplazmy (export RNA). Počas transkripcie je viazaný komplexom viažucim čiapky (CBC20 a CBC80), ktorý v spojení s ďalšími faktormi zaisťuje efektívny transport.

Strop má rozhodujúci význam aj pre začatie prekladu. Ako viazané CBC (počas prvého kola prekladu), tak eIF4E (počas všetkých nasledujúcich kôl) zaisťuje, že je ribozóm prijatý, a začína inicializáciou. To vedie k uzavretiu kruhu RNA (model translácie v uzavretej slučke), v ktorej 5'-koniec interaguje s poly A chvostom (prostredníctvom eIF4E, eIF4G a cytoplazmatického proteínu viažuceho poly A PABPC).

Pretože niektoré vírusy sa replikujú výlučne v cytoplazme, neprijímajú štruktúru viečka z bunkového aparátu. Za účelom kompenzácie nevýhod, ktoré to má za následok, „ukradnú“ čiapočku z bunkových mRNA, čo je známe ako vytrhnutie čiapočky. MRNA hostiteľského organizmu sa štiepi blízko 5'-konca (ktorý má na sebe čiapočku) a používa sa ako takzvaný „čiapočkový vedúci“ na zahájenie vírusovej translácie.